オビトールズ

スクリプトとライブラリ
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オビトールズ ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • CeCILL
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Eric Coissac
  • 出版社のWebサイト:
  • http://coissac.eu

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オビトールズ 説明

生物学的配列分析のためのスクリプトとライブラリ OBITOOLSは、私たちの実験室におけるシーケンスファイルの操作を簡素化するために作成されたPythonスクリプトのセットです。彼らは主に次世代のシーケンサーの出力(454またはSolexa)の分析中に私達を助けるために設計されました。これらのスクリプトは、同じ名前の「Obitools」のpythonライブラリに依存しています。それらは主にFASTAフォーマットでシーケンスファイルを操作するための施設を提供しています。他の形式はGenBankまたはEmbl. '' '' '' 'obitools' '' scriptSthe obitoolsスクリプトが、UNIXコマンドラインインターフェイスを使用して都合の良い方法でさまざまなデータとシーケンスファイルを操作するのに役立ちます。それらはコマンドラインプログラムのための標準のUNIXインタフェースに従い、パイプMecanismを使用して一連のスクリプトをチェーン化することを可能にします。複数のスクリプトで共有されているため、このオプションはこれらのスクリプトすべての同じ文字で名前が付けられています。これは、Obitoolsスクリプトの使用を容易にするために行われます。同様に、通常のスクリプトの名前は入力ファイルの形式を示すプレフィックスで始まります。このライブラリを自由に使用して独自のスクリプトを作成できます。要件: ・Python


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