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FLIPDCDそれは、バイナリDCD分子動力学軌道ファイルのエンディアニズムを逆転させます。
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  • ライセンス:
  • Free To Use But Rest...
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Jim Phillips
  • 出版社のWebサイト:
  • http://www.ks.uiuc.edu/Development/MDTools/flipdcd/

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フリップドリ 説明

FLIPDCDそれはバイナリDCD分子動力学軌道ファイルのエンディアニズムを逆転させます。 FlipDCDは、CharmmからのバイナリDCD軌跡ファイルのエンディアニズムを逆転させるための小さなユーティリティです。これは、1つのアーキテクチャ上のシミュレーションを実行し、awertherの結果を視覚化または分析するときに便利です。 HEADER.FLIPDCDのタイムスタックサイズの値は、CHARMM、X-PLOR、およびNAMD DCDの軌跡ファイルのエンディアニズム(バイト順序付け)を変換するためのメカニズムを提供して、反対のバイトの順序付けを持つプラットフォーム上の視覚化および分析プログラムによってロードされる可能性があるようになります。もともと生成されたプラットフォームのうち、Windows PCを使用して、SUNまたはSGIで生成されたDCD軌跡を読み取り、SUNまたはSGIがLinux.flipdcdを実行しているPCクラスタで生成された軌跡ファイルを読み取ることができます。 DCDファイルをMMAP()でマッピングし、エンディアニズムをインプレースに変換するメモリによるエンディアン変換。これにより、Endianness Conversignを実行するための比較的高性能な方法があります.flipdcdを使用して、DCDファイルのエンディアンステータスを報告すること、またはDCDファイルの原点に関係なく特定のエンディアン性を強制することができます.FLIPDCDの使用法:FLIPDCD ファイル。 。 。 "file"はファイルのリストにすることができます。デフォルトの動作はバイトの順序を反転することです。その他のオプションは次のとおりです。-s各ファイルを変更することなく各ファイルのバイトオーダーステータスを報告します。各ファイルBig-Endian -Lを作成/保存します。最後の1つの読み取りが使用されます.fixdcdは、X-PlorスタイルのDCDファイルのヘッダーを変更して、Charmmフォーマットの軌跡ファイルを期待するツールで読み取ることができます。 FLIPDCDと同様に、FIXDCDはその場での変換を実行します。この変換は可逆的ではないので、ファイルのバックアップコピーを作成したい場合があります。


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