 | 中央プロテオミクス施設パイプラインMS / MSプロテオミックデータの分析のためのパイプライン |
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中央プロテオミクス施設パイプライン ランキングとまとめ
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中央プロテオミクス施設パイプライン 説明
MS / MSプロテオームデータの分析のためのパイプライン 中央プロテオミクス施設Pipeline（CPFP）は、学術プロテオミクスコア施設のニーズを標的としたMS / MSプロテオミックデータの分析のためのパイプラインです。パイプラインは、LC-MS / MSプロテオミックデータセットの簡単で堅牢な検索、検証、および定量を提供するために複数の検索エンジンとトランスプロテオームパイプライン（TPP）ツールを使用しています.CPFPは現在Mascot（Matrix Science）、タンデム（ネイティブ）をサポートしています。そしてKスコア）、およびOMSSA。単一のフォームでは、パラメータファイルを作成したり、変更仕様の違いなど、3つのプログラムすべてへの送信を許可したり、データのボリュームとしてパイプラインを簡単にスケーリングすることができます。分析される。 ITRAQおよび同位体の標識量（Silac /重ジメチル/ ICAT）はPipeline.CPFPで実行できます。ここではCDDLライセンスの下でオープンソースソフトウェアとしてリリースされています。
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