 | 魔ma再配置ゲノム配列のグローバル多重アラインメントを構築する |
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魔ma ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- GPL
- 価格:
- FREE
- 出版社名:
- Aaron Darling
- 出版社のWebサイト:
- http://www.cs.wisc.edu/darling/libgenome/
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魔ma 説明
再配置されたゲノムシーケンスのグローバルな複数のアラインメントを構築します Mauve Projectは、並べ替えや反転などの大規模な進化イベントの存在下で複数のゲノムアライメントを効率的に構築するためのシステムです。 全ゲノムを整列させることは、短シーケンスの整列を整列させることよりも根本的に異なる問題である。マルチゲノムアライナは、適度な計算資源だけを必要とするという考えで開発されてきた。 それは整列されている配列の量でよくスケジュールするアルゴリズム技術を採用しています。例えば、一対のY。ペステスゲノムは1分以内に整列させることができ、一方、9の様々な腸内細菌ゲノムを数時間で整列させることができる。
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