 | 幽霊gemicalは、GUIおよび3D視覚化ツールを備えた分子モデリングパッケージです。 |
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幽霊 説明
gemicalは、GUIおよび3D視覚化ツールを備えた分子モデリングパッケージです。 GHEMICALは、GNU GPLの下で放出された計算化学ソフトウェアパッケージです。それは、パッケージの完全なソースコードが利用可能であり、ユーザーはパッケージを勉強して変更することができます。 gemicalはC ++で書かれています。gemicalプロジェクトはグラフィカルユーザーインターフェース（GNOMEに基づくもの）を持っており、それは両方の量子力学（半経験的およびab initio）モデルと分子力学モデルの両方をサポートしています（実験的なトリッス5.2のようなものがある有機分子の力場も還元タンパク質モデルのためのツールも含まれています。ジオメトリ最適化、分子動力学、および大きな視覚化ツールの大規模なセットが現在利用可能です。量子 - 機械的計算を提供するための外部コードに依存しています。半経験的メソッドMNDO、Mindo / 3、AM1、PM3はMOPAC7パッケージ（パブリックドメイン）から来て、ソース配布に含まれています.MPQCパッケージ（GNU GPL）はAB INITIOメソッドを提供するために使用されます.hartree-fockに基づく方法理論は現在STO-3Gから6-31G **の範囲の基底セットでサポートされています.MPQCコードはソース配布に含まれていません。gemicalでMPQCベースのab initioメソッドを使用するには、まずコンパイルしてインストールする必要があります。 theシステムのためのMPQCプログラム、そしてプログラムを一緒にリンクする特定の設定を使用してgemicalをコンパイルします。詳細については、インストールファイルを参照してください。 gemicalには、さまざまなファイル形式のインポートとエクスポート用のOpenBabelパッケージも含まれています（その他のタスク）。 「または等価に「Gunzip Ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf gemical-1.00.tar」。その後、「インストール」 - 追加情報を取得するために抽出した「インストール」 - ファイルを読んでください。このリリースでは新しくなっています。新しく追加されたWIN32ポートのため、オフィシャルな安定リリースではありません。
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