Bio :: Index :: Blast.

BIO :: Index :: Blastは、索引BLASTレポートを持つPerlモジュールであり、クエリアクセッションに基づいて検索をサポートします。
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Bio :: Index :: Blast. ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Perl Artistic License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Jason Stajich
  • 出版社のWebサイト:
  • http://search.cpan.org/birney/bioperl-1.4/Bio/PopGen/IO.pm

Bio :: Index :: Blast. タグ


Bio :: Index :: Blast. 説明

Bio :: Index :: Blastは、索引BLASTレポートを持つPerlモジュールであり、クエリアクセッションに基づいて検索をサポートしています。 Bio :: Index :: Blastは、インデックスBLASTレポートを持つPerlモジュールであり、クエリアクセッションに基づく検索をサポートします。シノプシスは厳密です。 Bio :: Index :: Blastを使用してください。 My（$ INDEXFILE、$ FILE1、$ FILE2）; My $ INDEX = NEW BIO :: INDEX :: BLAST（-filename => $ INDEXFILE、-WRITE_FLAG => 1）; $ INDEX - > MAKE_INDEX（$ FILE1、$ FILE2）; 私の$ ID; My $ DATA = $ INDEX - > GET_STREAM（$ ID）; My $ BPLITE_REPORT = $ INDEX - > FETCH_REPORT（$ ID）; 印刷 "query is"、$ bplite_report-> query、 "n"; 間（My $ sbjct = $ bplite_report-> nextsbjct）{印刷$ sbjct-> name、 "n"; 間（My $ HSP = $ sbjct-> nexthsp）{印刷 "t e-value"、$ HSP-> p、} "n"を印刷します。 このオブジェクトでは、Blastファイル（またはファイル）上のインデックスを作成し、そのアクセスのBlastレポートにすばやくアクセスできます。 注：最良の結果を「厳密に使用する」。 要件： ・Perl


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