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Bio :: SEQ :: SEQWithQuality. ランキングとまとめ
- ライセンス:
- Perl Artistic License
- 出版社のWebサイト:
- http://search.cpan.org/birney/bioperl-1.4/Bio/Seq/PrimaryQual.pm
Bio :: SEQ :: SEQWithQuality. タグ
Bio :: SEQ :: SEQWithQuality. 説明
Bio :: SEQ :: SeqWithQualityは、その品質を持つシーケンスをパッケージ化するBioPeerlオブジェクトです。 Bio :: SEQ :: SeqWithQualityは、Quality.Synopsisを使用したシーケンスをパッケージ化するBioPeerlオブジェクトです。 Bio :: SEQ :: PrimetalQualを使用してください。 #my $ qual = bio :: seq :: seqwithquality-> new(-qual => 'atcgatcg'、-id => 'Human_ID'、 -accession_number => 'al000012'、)。 ##オブジェクト#まず、PrimarySeqオブジェクトMy $ seqobj = bio :: primaryseq-> new(-seq => 'atcgatcg'、-id => 'genefragment-12'、-accession_number => 'x78121'アルファベット=> 'DNA')。 #今すぐMy $ Qualobj = Bio :: SEQ :: PrimoteQual-> New(-qual => '10,20505050202010'、-id => 'genefragment-12'、-accession_number => 'x 78121'、 - アルファベット=> 'DNA')。 #今すぐSeqWithQualityオブジェクトMy $ swqobj = bio :: seq :: seqwithquality-> new(-seq => $ seqobj、-qual => $ qualobj); # 終わり! $ SWQOBJ-> ID(); #seqwithqualityオブジェクト#のIDは、シーケンスのIDまたは品質のIDと一致しない場合があります(POD、Lukeをチェックしてください)$ SWQOBJ-> SEQ(); #seqwithqualityオブジェクト$ swqobj-> qual()のシーケンス。 #シーケンスの一部を出すためのseqwithqualityオブジェクト#の品質。 「シーケンス」、$ SEQOBJ-> ID()、「アクセション」、$ SEQOBJ-> accession、およびdesc "、$ seqobj-> desc、" n "; $ string2 = $ seqobj-> subseq(1,40);要件: ・Perl
Bio :: SEQ :: SEQWithQuality. 関連ソフトウェア