Bio :: Seqio :: FastQ.

Bio :: Seqio :: FastQは、FASTQシーケンス入出力ストリームです。
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Bio :: Seqio :: FastQ. ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Perl Artistic License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Tony Cox
  • 出版社のWebサイト:
  • http://search.cpan.org/birney/bioperl-1.4/Bio/SeqIO/fastq.pm

Bio :: Seqio :: FastQ. タグ


Bio :: Seqio :: FastQ. 説明

Bio :: Seqio :: FastQはFASTQシーケンス入出力ストリームです。 Bio :: Seqio :: FastQはFastQシーケンス入力/出力Stream.Synopsisdoこのモジュールを直接使用しません。 Bio :: Seqioクラスを介して使用します。このオブジェクトは、Bio :: SeqとBio :: SEQ :: SEQWithQualtyオブジェクトをFastQフラットファイルデータベースとの間で変換できます.faster Centerで頻繁に使用されるファイル形式はFASTAを束ねてシーケンスとその品質データ典型的なFASTAQエントリは、次のものを取ります。 + * ''）** 55ccf >>>>>>>> FastQファイルは、1行のシーケンスと品質データを持っており、品質値はシングルバイト符号化されています。各バイトから33（またはOCTAL 41）を減算し、次に「2桁+ 1スペース」の整数に変換する必要があります。常に「！」の最初のバイトがあるため、33が正しい番号であるかどうかを確認できます。 0の品質値に対応します。requirements：・Perl要件： ・Perl


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