Bio :: Tools :: Run :: Analysis

Bio :: Tools :: Run :: Analysisは、（リモートまたはローカル）分析ツールを表すPerlモジュールです。
今すぐダウンロード

Bio :: Tools :: Run :: Analysis ランキングとまとめ

広告

  • Rating:
  • ライセンス:
  • Perl Artistic License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Martin Senger
  • 出版社のWebサイト:
  • http://search.cpan.org/birney/bioperl-run-1.4/Bio/Tools/Run/Analysis.pm

Bio :: Tools :: Run :: Analysis タグ


Bio :: Tools :: Run :: Analysis 説明

Bio :: Tools :: Run :: Analysisは、（リモートまたはローカル）分析ツールを表すPerlモジュールです。 Bio :: Tools :: Run :: Analysisは、任意の（リモートまたはローカル）分析ツールを表すPerlモジュールです。 ）Bio :: Tools :: Run :: Analysisを使用します。印刷新しいBio :: Tools :: Run :: Analysis（-name => '編集:: sqret'） - > wait_for（{sequence_direct_data => 'tatatacgtatacga'、osformat => 'embl'}） - >結果（ 'OutSeq '））; ＃完了を待たずに長いジョブを実行するBio :: Tools :: Run :: Analysis。 My $ JOB = NEW BIO :: Tools :: Run :: Analysis（-name => '編集:: seqret'） - > run（{sequence_direct_data => 'tatatacgtatacga'、osformat => '}）; ＃...そしてwhile $ JOB->結果（ 'OUTSEQ'）。 ＃すべての結果が同じ呼び出しで（キーとしてのハッシュリファレンス＃として） - モジュールに、どの＃結果がバイナリ（この例のイメージ）であるかを決定し、それらのファイル（またはファイル）を保存します。また、モジュール＃がローカルファイルから入力データを読み取るべきであることを示す方法も示しています。最初にBio :: Tools :: Run :: Analysis; My $ Results = New Bio :: Tools :: Run :: Analysis（-name => 'alignment_multiple :: preattyplot'） - > wait_for（{msf_direct_data => '@ / home / testdata / my.seq'}） - >結果 （'？'）; DATA :: DUMPERを使用してください。印刷ダンパー（$結果）; ※短くて詳細（XML）の名前を取得し、詳細な（XML）サービスの説明Bio :: Tools :: Run :: Run :: Analysisを使用します。 My $ SERVICE = NEW BIO :: Tools :: Run :: Analysis（-name => '編集:: seqret'）; My $ HASH1 = $ SERVICE-> INPUT_SPEC; My $ HASH2 = $ service-> result_spec; My $ HASH3 = $ SERVICE-> ANALYSION_SPEC; My $ XML = $ SERVICE->説明しています。 ＃現在のジョブステータスを取得するBio :: Tools :: Run :: Analysisを使用します。印刷新しいBio :: Tools :: Run :: Analysis（-name => '編集:: seqret'） - >実行（{＃...入力データ...}） - >ステータス; ＃ジョブを実行してジョブIDを印刷し、ジョブの解凍を解除したままBio :: Tools :: Run :: Analysis; My $ JOB = NEW BIO :: Tools :: Run :: Analysis（-name => '編集:: seqret'、-destroy_on_exit => 0） - > run（{sequence_direct_data => '@ / home / testdata / mzef。 SEQ '}）; $ JOB-> IDを印刷します。 "n"; ＃...プリント（例えば）：＃edit :: seqret / c8ef56：-7FF4＃...別の時間に、別の惑星で、Bio :: Tools :: Run :: Analysisを使用することができます。 My $ JOB = NEW BIO :: Tools :: Run :: Analysis :: Job（-name => '編集:: seqret'、-id => '編集:: seqret / c8ef56：-7FF4'）;印刷結合（ "N"、$ JOB-> STATUS、 '終了：'。$ JOB->終了（1）、＃（1）は 'フォーマットされた' '経過時間を意味します：' $ JOB->経過、$ JOB- > Last_Event、$ JOB->結果（ 'OUTSEQ'））。 ＃...またはあなたは同じ維持モジュールを達成することができます。 My $ JOB = NEW BIO :: Tools :: Run :: Analysis（-name => '編集:: seqret'） - > create_job（ 'edit :: seqret / c8ef56：-7FF4'：-7FF4 '）;印刷参加（ "n"、$ JOB-> STATUS、＃...）; ＃...後でこのジョブリソースを解放することができます$ JOB->削除;ジェネレータのapplmaker.pl」を使用するための## ---の説明を参照してください：＃要件： ・Perl


Bio :: Tools :: Run :: Analysis 関連ソフトウェア

私たちに関しては