Bio :: Tools :: Run :: Primer3

プログラムPRIMER3からの出力を作成して作業を作成します。
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Bio :: Tools :: Run :: Primer3 ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Perl Artistic License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Christopher Fields
  • 出版社のWebサイト:
  • http://search.cpan.org/cjfields/

Bio :: Tools :: Run :: Primer3 タグ


Bio :: Tools :: Run :: Primer3 説明

PROGRAM PRIMER3の出力を入力して作業を作成します。 Bio :: Tools :: Run :: Primer3はPROML33.SYNOPSISBIO :: Tools :: PRIMER3からの出力を作成して作業するPERLモジュールです。 PRIMER3出力ファイル内のデータ。このモジュールはPROGRAM PRIMER3へのBIOPERLインターフェイスを提供します。詳細についてはhttp：//frodo.wi.mit.edu/primer3/primer3_code.htmlを参照してください。このモジュールはPRIMER3リリース1のために機能する必要がありますが、以前のバージョンで動作することは保証されていません。 ＃プライマーをいくつか設計します。 ＃出力はTEMP.OUTに入れられます.BIO :: Tools :: Run :: Primer3を使用します。 Bio :: Seqioを使用してください。 My $ seqio = bio :: seqio-> new（-file => 'data / dna1.fa'）; My $ seq = $ seqio-> next_seq; My $ PRIMER3 = BIO :: Tools :: Run :: Primer3-> New（-SEQ => $ seq、-outfile => "temp.out"、-ph => "/ usr / bin / primer3_core"）; ＃または事実の後、program_name $ primer3-> program_name（ 'my_suprefast_primer3'）を変更できます。 （$ primer3->実行可能ファイル）{print stderr "primer3が見つからない限り。インストールされていますか？ 「; exit（-1）}＃引数は何ですか？my $ args = $ PRIMER3->引数; print "引数意味 「; Foreach My $ KEY（キー％{$ args}）{印刷 "$ key"、$$ args {$ key} "） Primer $ PRIMER3-> add_targets（ 'primer_min_tm' => 56、 'primer_max_tm' => 90）の最大値と最小tmを設定します。 :: PRIMER3オブジェクトを実行します。 、$ results-> number_of_results、 "プライマー 「; Bio :: Tools :: Run :: Primer3 Primer3を使用してプライマーを設計するために必要な入力ファイルを作成し、Primer3の出力ファイル内のデータにアクセスするためのメカニズムを提供します。このモジュールはプログラムPrimer3にBioPeerlインターフェイスを提供します。http：//を参照してください。 www-genome.wi.mit.edu/genome_software/other/primer3.html詳細についておよびsoftware.developerのコメントモジュールは、Chad Matsallaによって書かれたものに基づいています。私は彼のコードのいくつかを破った、そしてたくさん追加しました私自身の要件： ・Perl


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