CSB. 計算構造生物学ツールボックス
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CSB. 説明

CSBはPythonライブラリとアプリケーションフレームワークであり、これは計算構造生物学の分野における問題を解決するために使用することができます。あなたがバイオインフォーマン、ソフトウェアエンジニアまたはこの分野で働く研究者であるならば、あなたはここで有用なものを見つけるかもしれません。私たちのパッケージはいくつかの主要な要素で構成されています：1。コアクラスライブラリ - オブジェクト指向、粒状、デザインとクリーンインタフェースを強調します。 Application Framework - Consoleアプリケーション（「プロトコル」）。実行可能ファイル（そしてうまくいけば便利な）.3。 Test Framework - ライブラリが実際にWorks.CompatibilityIn Short：Python 2.7以降のLinuxでは、Python 2.6以降のCSBが開発されていることを確認します。ただし、互換性は設計目標であり、パッケージはバージョン2.6以降の最新のPythonインタプリタ上で任意のプラットフォームで動作します（はい、箱からPython 3サポートを含む）。開発環境とは異なるプラットフォーム/インタプリタの問題が見つかった場合は、お知らせください。私たちは親切に謝罪し、問題を解決し、回帰テストケースを書いて、問題が一度だけ解決されるようにするために回帰テストケースを書いてください。そうであれば、CSBが依存するいくつかの簡単なパッケージのインストールを続行します。 numpy - 必須（numpy.scipy.org）2。 SCIPY - 必須（SCIPY.ORG）3。 matplotlibとwxpython - オプションで、csb.io.plots4を使用したい場合にのみ必要です。 UnitTest2 - Python 2.65を使用している場合にのみ必要です。 argparse - Python 2.6を使用している場合は、Python 2.6を使用している場合は、Numpy、Scipy、MatpLoTLIBをバイナリMSI / EXEパッケージからインストールできます。残りはPYPIからインストールできます。 Debian様Linuxディストリビューションでは、Package Managerを使用します.APT-GET INSTALL * PACKAGE * Python-numpy、python-scipy、python-matplotlib.finally、CSB自体のインストール：Python Setpy.py InstallCSB次の場所にインストールされています.python -c "CSB、OSをインポートします。印刷（OS.ABSPATH（OS.ABSPATH（CSB.ABSPATH（CSB._______________）「このパスlibを呼びましょう」） .TestingRunning CSBテストスイートは、ソースコードに変更を加えた場合、または単にインストールのWorks.All CSBテストがCSB.test.Consoleで実行されているかどうかを確認したい場合に役立ちます。コンソールを実行するための典型的な方法は、次のとおりです。 CSB / test / app.py -hこのテストフレームワークの詳細については、単体テストのガイドラインを含めて、APIのマニュアル、パッケージ「CSB.Test」。製品のホームページを参照してください。

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