MACS2

CHIP-SEQデータのモデルベース分析
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MACS2 ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Artistic License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Tao Liu
  • 出版社のWebサイト:
  • http://github.com/taoliu/

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MACS2 説明

MACS2は、Chip - Seqデータのためのモデルベースの分析ツールである。シークエンシング技術の改善、クロマチン免疫沈降、続いてハイスループットシークエンシング(Chip-Seq)が、ゲノム全体のタンパク質-DNA相互作用を研究するのに一般的になっています。 強力なチップ - Seq分析方法の欠如に対処するために、転写因子結合部位を同定するための、Chip - Seq(MACS)のモデルベース分析という新規なアルゴリズムを提示する。 Macはゲノム複雑さの影響を捉えるための、濃縮されたチップ領域の意義を評価するために、Macが配列決定タグ位置と配向の両方の情報を組み合わせることによって結合部位の空間分解能を改善する。 MACは、Chip-Seqデータのみで、または特異性の増加を伴う制御サンプルで簡単に使用できます。製品


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