Seedwatersegmetter エッジラベル付き組織内の細胞の画像スタックを対話的にセグメント化するためのグラフィカルなPythonプログラム
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Seedwatersegmetter 説明

SeedwaterSegmetterは、エッジラベル（AKA。白いアウトライン）と組織内の細胞の画像スタックを対話的にセグメント化するためのグラフィカルなPythonツールです。相互作用は全体的に種子の編集に基づいており、それは今度は流域アルゴリズムによって拡大される。 SWSとその他のツールの主な違いは、セルごとに複数のシードを配置することができます。難しいセルの境界を調整するのに役立ちます。 、それは稲妻高温のアルゴリズム（Mahotasプロジェクトのおかげで）を使用し、リアルタイムの更新を可能にします。それは単純な（雑然とした）UIを持っていて、1レベルのUNDOを含めても完全にインタラクティブです。 /cyto.a.22034/abstractSourceコードは4つのリポジトリとPyPiにミラー化されています。 http://gitorious.org/SeedWaterSegmenter - Googleコード：http：//code.google.com/p/seedwater/--pypi：http：//pypi.python.org/pypi/seedwaterSegmenterユーザーGoogleコードページにはいくつかのバイナリがあります。 32ビットウィンドウまたは64ビットLinuxで動作するはずですが、これらは現在古くなっています。 "easy_install"メソッドを使用してください。詳細については、Pythonのインストール手順20xx.txtを参照してください。実際のSequer Sectryer V xx manual.txtinstallingと走行インストールはついに簡単です！実際には、「easy_install」 SeedWaterSegmetter "Quick命令：Windows / Mac：インストール中のPythonの配布http://www.enthoute.com/products/edudownload.phpubuntu/debian：sudo apt-get python-wxtools python-wxtools python-numpy python-scipy python- MATPLOTLIB Python-Imaging Python-XLRD Python-XLWTIN A CMDウィンドウ（Windows Vista / 7の管理者として実行する必要があります）または端末（Mac / Linux）、実行：easy_install mahotas cmpgen ellipsefitter filenamesort Giftiffloader ImageContour SeedWaterSegmenterDetailed命令：最新バージョンが呼び出されます。 "Python Install Installs Implication Installs 2012.txt" https://github.com/davidmashburn/seedwatersegmenter/blob/master/pythonインストール手順2012.txtproductのホームページ

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