brain brain ラット脳アトラスへのPython界面
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Brainatlasは以下の目的を持つPythonモジュールです。与えられた場所の画像4）著作権の理由から、平らになった皮質表面的な場所の場所を著作権の理由からプロットします。このモジュールは、ラット脳のアトラスに付属のCDからのEPSファイルを含まない。ただし、これらのファイルはモジュールが機能するために必要です。epsファイルのパスを必要な関数（セクション._ init__など）に渡すか、または（少なくともコロナセクションの）EPSファイルをATLAS / EPSにコピーすることができます。 。How閉じるセクションのセクションインデックスを忘れてください>>> pyatlas.pyセクション6.53.5 -7プロットの場所（プロットの表示と保存）>>> pyatlas.pyセクション6.53.5 -7 - Apget場所>>> Pyatlas.pyエリア6.53.5 -7エリアのポイントクラウド（Meshes / .asc） >>> pyatlas.pyポイントv2l -mplot flatted cortex >>> pyatlas.py cortex 6.53.5 -7 - 平らになった皮質表面上のプロットを描くためのスケールの呼び出しは、地域のポイントが非常に早くなります。>>> pyatlas.pyエリア-p area.p >>> pyatals.py cortex -a Area.pnotesthisは、ラベル付き脳Atlas ImagesSTepsのスタックから選択された脳領域の3Dメッシュを生成することでした.1）脳のepsファイルを取る各EPSファイル内の選択されたエリアラベルのindの場所は、EPSファイルをビットマップフォーマットにレンダリングします4）選択された範囲の境界に対応するピクセルを見つけます5）各スライス7の境界線の出力3D脳座標） PointSthsからメッシュを生成するためにMeshlabを使用してください。エリア用のポイントファイル（ex：v1.ass）2）ポイントを簡素化する：フィルタ - >クリーニング - >マージ：.05 World Units3）メッシュとして保存（例：.ply）4）RELOAD3）ポイントをメッシュ：フィルタ - >表面再構成（ボールピボット）：.5ワールドユニット（またはV2L用）5）スムーズholes5）スムーズ：フィルター - >スムージング - >ラプラススムーズ：2 iterations6）メッシュとして保存（例：。 PLY）製品のホームページ

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