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LSIMは高分子電子密度を重ね合わせ、構造的類似性スコアを計算する。 LSIMは高分子電子密度を重ね合わせ、構造的類似性スコアを計算する。 その計算は比較される分子のサイズと直線的にスケールされる。LSIMアラインメントは生化学的構造要素と概念的に無関係であり、したがって構造のみのタンパク質類似性研究に適したものであり、偏り：akpack：tar -xzvf lsim -linux.tar.gzMoveからファイルディレクトリへ：CD LSIM.1.0.0copy実行可能ファイルLSIMを適切な場所に移動またはリンクします。 - およびLSIMがパス環境変数を介してアクセス可能であることを確認します。 - CP LSIM / usr / local / Binset変数LSIMDIRは、選択されたLSIMディレクトリを指すようにします。例えば：setenv lsimdir /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0

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