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MyGene.Infoサービス用のPythonクライアント
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • BSD License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Chunlei Wu
  • 出版社のWebサイト:
  • https://bitbucket.org/newgene/

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my my 説明

MyGene.Infoは、遺伝子注釈データを照会/取得するための簡単なREST Webサービスを提供します。それは単純さと性能を強調して設計されています。 MyGeneはMyGene.infoサービスにアクセスするための使いやすいPythonラッパーです。インストールオプション1 PIPのインストールPIP Install -E HG + HTTPS://bitbucket.org/newgene / mygene#G = mygeneusagein :Mygenein :MG = Mygene.MygeneInfo()In :Mg.getgene(1017) :{'_id': '1017'、 'name': 'Symbol': 'Symbol': 'cdk2'} in :MG.getgene(1017、 '名、記号、REFSEQ ')out :{' _ ID ':' 1017 '、' Name ':' Cyclin-Dependent Kinase 2 '、' Refseq ':{' Genomic ':、 'TONATELU':、 'RNA':}、' Symbol ':' CDK2 '}:MG.GetGene(1017、' Name、Symbol、Refseq.rna ')OUT :{' _ ID ':' 1017 '、'名称 ':「サイクリン依存性キナーゼ2」、' Refseq ':{' RNA ':}、' Symbol ':' CDK2 '} In :Mg。 getgenes()OUT ::mg.query( 'cdk2'、limit = 5)OUT :{'etag': '1358E787924ddb'、 'limit':5、 'rows':、' skip ':0、' total_rows ':29} in :mg.query( 'Reporter:1000_at')OUT :{'Etag': '13574eee908e81'、 'Limit':25、 'Rows':、、、、、、 'ID':55682}、 'ID': ' 5595 '、' Name ':' Score ':' Scork ':' Mapk3 '、' Taxid ':9606}]、' skip ':0、' total_rows ':1} in :MG.QUERY( 'Symbol:CDK2と種:Human')OUT :{'etag': '1358E787924ddb'、 'limit':25、 'rows':、、 、362817]、、、、 'ID':74409}、 'ID': '1017'、 'Name': 'サイクリン依存性キナーゼ2'、 'scork': 'cdk2'、 'tockid':9606}]、 'skip':0、 'total_rows':1} in :mg.findgenes( 、scope = 'entrezgene'、種= 'ヒト')クエリ1-2 ...完成しました。 695 '、' 695 '、' BTK '、' Btk '、' Bruton Agammaglobulinemia Tyrosine Kinase ')in :Mg.Findgenes(、scope =' entrezgene '、speies = 9606)クエリ1-2 ...完成しました:] :MG.FindGenes(、Scope = 'Entrezgene'、speies = 'ヒューマン')クエリ1-3 ...完成した入力IDがヒットしない: ::Mg.Findgenes(、scope =' entrezgene '、種='ヒト '、RAW = TRUE)クエリ1-3 ...完成しました。 ]、、、、、、 'ID':74409}、 'ID': '1017'、 'キー':、、、、 'ID':30953}、 'ID': '695'、 'Key':製品のホームページ


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