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Perlインターフェースタンパク質データバンクへのインタフェース
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Perl Artistic License
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Miorel-Lucian Palii
  • 出版社のWebサイト:
  • http://search.cpan.org/miorel/

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www :: PDB. 説明

Perl Interface.タンパク質データバンクへのインタフェース タンパク質データバンク（PDB）は、タンパク質構造の原子座標のリポジトリとして1971年に設立された（Bernstein et al。、1997）。それは、研究コミュニティだけでなく学生や教育者にとっても非常に貴重なことを証明していた以来、タンパク質データバンクへのインターフェースとして設計されたPerlモジュールです。ファイルを取得するための機能を提供し、オプションでそれらをローカルにキャッシュします。さらに、PDBのSOAP Webサービスの機能をラップします..SYNOPSIS WWW :: PDB QW（：ALL）を使用します。 ＃ダウンロードwww :: pdb-> cache（ '/ foo / bar'）をダウンロードするためのディレクトリを設定します。私の$ fh = get_structure（ '2LI'）;印刷してください。 My @pdbids = www :: pdb-> keyword_query（ 'Carbonic Anhydolare'）; （@pbids）{My $ Citition = www :: pdb-> get_primary_catute_title（$ _）、My @Chains = www :: pdb-> get_chains（$ _）; printf（ "％s％s "、$ _、$引用、join（ '、'、@chains））;;; My $ seq = q（vlspadktnvkaawkvgahageygaealermftttk tyfphfdlshgsaqvkghgkkvaDaltavahvkghal）;印刷www :: pdb-> blast（$ seq、10.0、 'blosum62'、 'html '）; 要件： ・Perl


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