イントロンマーカーパイプライン ゲノム配列が限られていない種の鋳型としてのESTを用いたイントロンフランキングプライマーの設計
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イントロンマーカーパイプライン ランキングとまとめ

イントロンマーカーパイプライン タグ

順序 イントロンマーカーパイプライン 表現されたシーケンスタグ ESTシーケンス EST（東部基準時） イントロン

イントロンマーカーパイプライン 説明

ゲノム配列が限られていない種の鋳型としてのESTを用いたイントロンフランキングプライマーの設計 イントロンマーカーパイプライン（IMP）パイプラインは、発現された配列タグ（EST）において予測されたイントロン位置をフランクするプライマーの設計のための自動化されたツールとして開発されてきた。イントロンマーカーパイプライン（IMP）は、利用可能なゲノム配列データなしに限定されていない種を説明することを目的としている。入力に必要なのは、ESTシーケンスを含むFASTAファイルと、イントロン予測に使用されるゲノムシーケンスを含むもう1つのFASTAファイルです。これにより、ユーザーに最適な柔軟性が可能になり、使用されている正確なシーケンスを制御できます。インストール手順：・現在配布をダウンロードします・ターミナルのtar -zxvf filenameを使用して、tar -zxvf filenameを使用して、ReaPeatmasker、Blat、GeneseQer、Primer3のコマンドラインユーティリティを使用して、インストールされているコマンドラインユーティリティ、およびそれぞれの実行可能ファイルへのパスを下にダウンロードします。 1つ（ex：/ usr / local / share / applications / primer3 / src / primers_core）・impのベースディレクトリにperl install.plを実行する・プロンプトの要件のときに既に注意しているパスを入力します。 ・リピートマスカ ・ブラット ・ジェニーゼル ・Primer3コマンドラインユーティリティ

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