エポ 系統解析と可視化のためのモジュール式ソフトウェアフレームワーク。
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エポ 説明

系統発生分析と可視化のためのモジュール式ソフトウェアフレームワーク 系統発生分析と可視化のためのモジュラーソフトウェアフレームワークであるEPOSを提示します。既存の系統発生ソフトウェアは2つのグループに分割することができます。特定の問題に対する計算方法、および結果を分析するための視覚化ツールを提供するアルゴリズムパッケージ。多くのアルゴリズムツールは、それらがしばしばコマンドラインベースであるため、視覚化が低いグラフィカルユーザインタフェースに悩まされることが多いため、ユーザビリティが不足しています。 EPOSは、強力なグラフィカルユーザーインターフェースをプラグインシステムと組み合わせることで、新しいアルゴリズム、視覚化、およびデータ構造を簡単に統合できます。または適用された方法。現在、EPOSは、距離ベースのツリー再構成、ツリー距離、コンセンサスツリー、およびスーパーツリー方法のためのアルゴリズムを提供します。すべてのメソッドはパイプラインシステムに統合されています。これは、データフローがシステムによって自動的に処理される方法の組み合わせを可能にするパイプラインシステムに統合されています。包括的なツリービューはEPOSに含まれています。それは異なるレイアウト、色付け、注釈、そして輸出機能を提供し、樹木を数千の葉までスムーズにレンダリングすることができます。視覚化がモジュラーシステムの一部であるため、それらは任意の方向に延長され、新しい可視化モジュールを統合することができ、例えば系統性ネットワークを処理することができます。データ処理を単純化するために、EPOSを使用すると、使用されているすべてのデータセットを含む永続ワークスペースを作成できます。ワークスペース内の情報は、拡張可能で透過的なバックエンドモジュールに永続的に保存されています。 ・新機能を含まないが、「インストールパスにスペースを使用しない」という問題を含む、最も積極的なバグの一部を修正します。

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