ゲームビューア

次世代シーケンスデータのクロスプラットフォームビューアと解析ワークベンチ
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ゲームビューア ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Derek Barnett
  • 出版社のWebサイト:
  • http://code.google.com/u/DerekWBarnett/
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X
  • ファイルサイズ:
  • 10.2 MB

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ゲームビューア 説明

次世代シーケンスデータのためのクロスプラットフォームビューアと分析ワークベンチ Gambit Viewerは、シーケンス分析であなたを助けることを目的とした新しいグラフィカルユーザーインターフェース(GUI)アプリケーションです。Gambit Viewerソフトウェアは、(公正に)ゲノムへの迅速なアクセスを可能にする(公正に)最近標準化されたBAMシーケンスの配置形式の索引付け機能を利用します。最小限の起動時間と再レンダリング遅延を持つデータ。 Gambit Viewerはまた、Gene / Region Annotationを表示するためのさまざまな注釈フォーマット(BED、GFF、GFF3、VCF) "Out-of-Box"をサポートしています。ゲームビュービューアは現在 "Plugin-Aware"です。フォーマットサポートに関しては、メインプログラムを変更/アップグレードすることなく新しいフォーマットのサポートを追加することができます。ビジュアライゼーションソフトウェアが不可欠な分析機能を統合している場合、より小さな生物学研究所の分析ニーズを提供できます。そのような機能性は、候補SNP検証実験を支持するためのPCRプライマー設計を含む。共通データベースへの接続詳細および集中的な分析のために染色体の特定の領域からデータをエクスポートするプラグインを介して分析システムを実装することの1つの利点は、プログラミングスキルを持つ人なら誰でも自分のカスタム機能を容易に含めることができるということです。もう1つの利点は、ユーザーがすべてのプラグインを追加する必要がないということです。必要に応じて、Gambit Viewerを軽量または完全に機能的にするようにカスタマイズできます。要件: ・Java.


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