| コドンコードアライナ 配列アセンブリのための大きな適用、コンティグ編集および突然変異検出 |
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コドンコードアライナ ランキングとまとめ
- 価格:
- USD 960.00 | BUY the full version
- 出版社名:
- CodonCode Corporation
- 出版社のWebサイト:
- http://www.codoncode.com/index.htm
- オペレーティングシステム:
- Mac OS X 10.3.4 or later
コドンコードアライナ タグ
コドンコードアライナ 説明
シーケンスアセンブリのための非常に適用、コンティグ編集および突然変異検出 CodonCode Alignerは、WindowsおよびMac OS Xに使用可能なシーケンスアセンブリ、コンティグ編集、および突然変異検出のためのプログラムです。アライナはPhred-Phrapと互換性があり、よく知られている学習されたユーザーインタフェースを提供しながら、シーケンス品質スコアを完全にサポートしています。 .codonCode Alignerを使用すると、複雑なコマンドラインオプションやPerlプログラミングを学ぶことなく、ベースの呼び出しとシーケンスアセンブリの現代のアルゴリズムを最大限に活用できます。 "CodonCode Aligner"の主な機能はいくつかあります。 ・テキストファイルからのシーケンスをインポートする。 ・ABIファイルとSCFファイルからのインポートシーケンス。 ・エンドクリップ。 ・ベクトルトリム。 ・コンテグを組み立てます。 ・参照順序に合わせます。 ・接続しながらコンティグを互いに整列させます。 ・サンプル名に基づいて、グループに組み立てたり揃ったりします。 ・ヘテロ接合変異を見つけます。 ・ヘテロ接合挿入や欠失を分析します。 ・関心領域(「特徴」)、例えば低品質のコンセンサス地域を定義する。 ・ユーザー定義の機能間ですばやく移動します。 ・フレーズ生成アセンブリのインポートおよび編集。 ・Aligner Projectsから直接PhredとPhrapを実行します。 ・機能とシーケンスをエクスポートする可能性もあります。 ・保護対応の組み立てプロジェクトを輸出する。 制限事項 ・30日間の試用期間。 ・あなたはあなたのプロジェクトでアセンブルされていないサンプルだけを使うことができます。 ・また、コンテグを含むプロジェクトから、または制限されていない機能を試した後(Alignerが最初に警告する)にも保存、エクスポート、または印刷することはできません。このリリースの新機能: ・すべてのサンプルのアミノ酸翻訳。 ・タンパク質翻訳ベースの背景色。 ・差分テーブル。 ・GenBankから直接インポートする。 ・スクリプトメニュー。 ・新しいスクリプトコマンド。 ・454データ(SFFファイル)をインポートします。 ・新しいテキストシーケンスを作成します。 ・より大きなプロジェクトをサポートする。 ・アセンブリより速いアセンブリ。 ・Windowsで自動メモリを使用します。 ・ペンタブレットのサポートが改善されました。
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