シリアルクローン DNAクローニング、配列分析、および可視化を支援する直感的なインターフェースを備えたツールを提供します。
今すぐダウンロード

シリアルクローン ランキングとまとめ

シリアルクローン タグ

クローン d d 分子 シーケンス分析 DNAクローニング DNAを視覚化する

シリアルクローン 説明

DNAクローニング、配列分析、可視化を支援する直感的なインターフェースを使用してツールを提供します。 シリアルクローンは、DNAクローニング、シーケンス分析、および視覚化を支援する直感的なインターフェースを使用してツールを提供する分子生物学ソフトウェアです。これは、最も要求された機能強化である機能/注釈を処理します。ユーザーは任意のシーケンス部分に注釈を付けるか、自動スキャンを使用して共通の機能を検出できます..Serial ClonerはDNAストライダー互換ファイルを読み書きすることができ、FASTA形式でファイルをインポートまたはエクスポートできます。また、このバージョンの新機能は、PRAW32シーケンスと同様に、APEとVectorntiファイルを自分の機能で読み取る可能性です。 GenBank / EMBLファイルは、含まれているWeb Interfaceを使用してインターネットからインポートまたは読み取ることもできます。パワーフルのグラフィカル表示ツールとシンプルなインターフェースは、非常に直感的な方法で分析と構築のステップを支援します。シーケンスを分析して操作するために必要なすべてのツールは、オールインワンウィンドウの概念で利用可能です。すべてのキー関数はCompact Interface Clonerを介してアクセス可能で、テキスト制限マップを構築し、マルチフレームの変換を追加するか、たとえばシングルカッターを表示するように迅速にフォーマットすることもできます。シリアルクローンのグラフィックマップは、フィーチャ、フラグメント、またはShow Singer、Doubleまたは複数のカッターを同じウィンドウで簡単に選択して抽出できます。あなたの建造物の電子バージョンを準備する。クラシック制限マップ - グラフィックとテキストベースの両方のまたはサイト使用済みウィンドウの両方で、PCRベースの増幅または合成アダプタを準備することができるようになります。所定の足場に基づくshRNA構築物も自動化されている。PCR、アダプター/ shRNA合成によって得られた断片を組み立てることができます。必要に応じて選択し、まとめると、Ligateボタンをクリックします。最後に、シリアルクローンは、ローカルアルゴリズムまたはBLAST2SEQ NCBIサーバを使用して2つのシーケンスを整列させ、コンセンサスAの仮想カッター、NCBI / EMBLエントリのインスタントインポート付きWebブラウザ、およびサイレント制限マップジェネレータも可能です。 FASTAフォーマットのテキストまたはファイルをすばやく準備するには、マルチアライメント要求をクラスタに送信します。このリリースの新機能： ・シリアルクローンは機能/注釈を処理するようになりました。機能は手動またはスキャンによって追加することができます（Bellow）。 ・シーケンスウィンドウ内の新しいパネル機能/注釈を管理する ・機能を自動的に検出するためのスキャン機能（シーケンスウィンドウとツールバーの両方で利用可能）。現時点では、内部データベースを使用します。シリアルクローンの次のバージョンでは、ユーザーリストを定義できます。 ・グラフィックマップで直接利用できる自動スキャン（ツールバーまたはメニューから入手可能） ・グラフィックマップ内のセグメントを選択した後に機能を追加します。 ・グラフィックマップの機能名をダブルクリックすると、シーケンスウィンドウ内の機能シーケンスの ・現在開いているすべてのシーケンスを含むマルチシーケンスファースト整形ファイルを組み立てて保存します（マルチシーケンスアラインメント（例えば、Clustal）送信に役立ちます） ・クリップボードに組み立ててコピーしているすべての開いているシーケンスを含むマルチシーケンスファースト形式のテキスト（マルチシーケンスアラインメント（例えば、Clustal）送信に役立ちます） ・クラッシュしている（うまくいけばまれに）未保存シーケンスの自動回復。 ・マウスホイールを使ってシーケンスとグラフィックマップウィンドウでスクロールする。 ・ユーザーはグラフィックマップウィンドウの幅を変更できます ・選択したフラグメントのサイズがグラフィックマップに表示されるようになりました ・グラフィックマップの制限サイトと機能名をドラッグアンド配置します。 ・シリアルクローンは、縮退シーケンスファイルが開かれているかどうかを推測しようとします。 ・ベクトルNTIシーケンスを自分の機能でインポートします。 ・ APEシーケンスを自分の機能でインポートします。 ・ genbankシーケンス（ファイルから）を自分の機能でインポートします。 ・メジャー関数（輸入、縮退シーケンスなど）にいくつかのショートカットが追加されました ・ Alt-octingを使用して、ツールバーで利用可能な代替コマンドを表示します（新しい縮退シーケンス、インポート、インタラクティブサイトの使用状況）。 ・システム設定を使用した自動インターネットプロキシ検出（MacOSXの下の.pacファイルを使用する場合は機能しないようです）。 ・ MacOSX：シーケンスが変更されて保存されていない場合は、ウィンドウのプロキシ（赤色のブラックドット）が表示されます。 ・シーケンス名は、名前をダブルクリックするか、Ctrlキーを押しながら使用できるコンテキストメニューを使用して、シーケンス名をクリックしてシーケンス名を直接変更できます。 ・環境設定ウィンドウ（インターネットプロキシ管理、非シリアルクローンファイルのインポート時に警告）に追加のパラメータを設定できます。 ・グラフィックマップウィンドウで拡張されたコンテキストメニュー ・ GenBank、EMBL、DDBJ、VNTI、PDRAW32、またはAPEのシーケンスを開くときにシーケンスウィンドウに表示されている正しいシーケンスフォーマット表示。 ・ Webアクセスウィンドウ（および自動解析ボタン）を使用したNCBIシーケンスのインポートが改善されました ・Blast 2シーケンスソフトウェアを使用してNCBIでのアラインメントが再確立されます。 ・ほぼ完全ではなく、NCBIシーケンスのレイアウトを尊重するシーケンスのインポートを向上させます（Webアクセスウィンドウを使用して）。 ・新しいバージョンの可用性を発表するために使用されるウィンドウのインターフェースを変更します。 ・ XXXXX、-A、-B、またはXXXXX、-A、+ Bのような特定のタイプIIS制限酵素の取り扱い。 ・グラフィックマップで選択することなくCW / CCWを変更するときに発生したクラッシュ。 ・非常に長いシーケンスを増幅するときにPCRのバグが発生した（32 K） ・ MacOSX：「制限酵素管理」ウィンドウの引き出しウィンドウの動作のバグ。 ・ウィンドウの「ビルド」ウィンドウのフラグメント選択のバグ。 ・整列出力の一部を削除していたローカルアライメントのまれなバグ ・ポップアップウィンドウは表示されなくなりましたが、シーケンスがロックされていたことが「保存として保存」コマンドを使用すると表示されます。 ・ローカルアライメントウィンドウの整列ヌクレオチドの算出は補正されました。 ・シリアルクローンのヘッダー内のアクセント文字を含むFASTAファイルをインポートするためのバグ。 ・マッキング：シーケンスウィンドウの「検索」引き出しでインタフェースグリッチ ・ウィンドウズ：検索ウィンドウの「貼り付けコマンド」の問題。 ・マイナス鎖からDNAが翻訳された場合、翻訳欄からDNAを選択したときに発生する虫。 ・ウィンドウの「構築」ウィンドウで縮退制限酵素に影響を与えるバグ。

シリアルクローン 関連ソフトウェア