| ストリーム 静的熱力学モデルを用いた転写調節をモデル化するためのフレームワーク |
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ストリーム 説明
静的熱力学モデルを用いた転写調節モデルをモデル化するためのフレームワーク Stream Javaアプリケーションの名前は、次の長い名前の略語です。静的熱力学的調節モデルの転写。簡単に言うと、Streamは特定の遺伝子の転写調節をモデル化し、異なる状況でその転写出力を予測したい研究者のためのバイオインフォマティクスアプリケーションです。標的遺伝子の割合は、遺伝子の転写調節を細かく転写調節することは、ゲノムの調節文法を発見しそして最終的に利用するための重要なステップである。熱力学的方程式を用いた転写調節のモデル化は、この目標に向かってますます重要なアプローチとなっています。調節DNA領域の一組の転写因子結合部位の濃度および標的遺伝子の濃度はその最適化するであろう。入力データに最も適したモデルを生成するためのパラメータ。この訓練されたモデルを次のものに使用することができる。・与えられたTFSのセットが標的遺伝子を調節し、そして異なる条件下で転写速度を予測することができることを検証する(例えば、異なる組織、ノックアウト/追加のTFSまたは突然変異/欠けているTFBS)。要件: ・Java.
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