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ゲノムハイブリダイゼーションデータを視覚化して比較するように構築されたプログラム Snoopcghは、比較ゲノムハイブリダイゼーション(CGH)データを視覚化して調べるために構築された無料のオープンソースのJavaデスクトップアプリケーションです。 Snoopcghは、ユーザーが複数のデータを同時に対話的に分析することを可能にします。入力は、1つ以上の比較またはサンプルに対応する一連の対数強度値を含むタブ、スペースまたはコンマ区切り形式に基づいています。マウスと対話的に検討できる無制限のズーム(両方の軸)。積み重ねられて組み合わせることができる複数の層の使用は、データの視覚化を容易にします。 CGH比をフィルタリングするか、関心領域で統計分析を行うために、いくつかの層をプロットに適用することが可能である。分析方法が実施され、推定構造変動の迅速な可視化および推定構造変動(SV)。 Snoopcghは、遺伝子名とゲノム機能(例えばGC含有量)に関する情報を含む、ゲノムブラウザからのダウンロード可能な注釈ファイル(例えばEMBL)とインターフェースする機能です。ユーザは、プロットの麓における注釈の視覚的表現を有し、それらをクリックするか、またはテキスト検索によって詳細なテキスト情報に簡単にアクセスすることができる。主なゲノムブラウザへの直接リンクが組み込まれています。要件: ・Java 1.6以降
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