トリプレクサー 核酸三重らせんの予測のための計算ツールキット
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二本鎖DNAは、その主溝内に第3のヌクレオチド鎖を収容することによって三重らせん構造を形成することができる。この配列特異的プロセスは、関心のあるゲノム遺伝子座を標的とする強力なメカニズムを提供し、それは生物技術的および遺伝子治療的用途にとって非常に興味深いものである。トリ胎児形成は二本鎖、おそらくDNA、およびそのように作用する一本鎖ヌクレオチド配列を必要とする。第3の鎖、おそらくRNA。配列データ中の推定トリプレックスを予測するプロセスは、3つのステップに分けられ得る。・一本鎖配列中の三重鎖形成オリゴヌクレオチド（TFO）を同定する・二本鎖配列における三重鎖標的部位の同定第3のストランドを占めるために・第3のストランド・潜在的TFO / TTSペアの互換性を評価する標準トリプレックス形成規則に従って、トリプレクサは、推定TFO - TTSペア（トリプレックス）を見つけるために三重形成規則に基づいて近似パターンマッチングを使用するアプリケーションである。 1つのセットに2組のヌクレオチドシーケンスが含まれており、一部のセットにはデュプレックスシーケンスとその他のTHDetailed命令がインストール方法についてMacでTriplexatorユーティリティを使用することができます。

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