ハプロゲンマッパー

セグメント重複に対するHAPloInsuffical遺伝子のゲノム近接のためのオープンソースビジュアライザ
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • HaploGeneMapper Team
  • 出版社のWebサイト:
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X
  • ファイルサイズ:
  • 40 KB

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ハプロゲンマッパー 説明

セグメント重複に対するHAPloinsuffical遺伝子のゲノム近接のためのオープンソースビジュアライザ HaplogeneMapperは、染色体ごとのアシロモソームごとに、HAPLOOMOSOME BASE基準でのセグメント重複に対するセグメントの重複に対するゲノム近接を視覚化するように構築された自由でオープンなソースツールです。非対立遺伝子相同組換えを受ける可能性がある分節重複対の対を使用して強調表示することができます。カーソル。同様に、HAPLOINSUHPの名称とセグメントの重複の名前は、それらの上にカーソルをホバリングすることによって表示されます。必要ならば、ユーザは、所望の領域の開始座標および終了座標を提供することによって、ユーザは選択された染色体のセクションにズームすることができる。 "HaplogeneMapper"の主な機能は次のとおりです。 ・1つ以上の染色体上の特徴のカラフルで明確でカスタマイズ可能な視覚化同時に。 ・染色体の任意の部分をズームインします。 ・非常に単純な入力フォーマット。テキストファイル内の遺伝子またはセグメントの重複の定期的なリストから入力ファイルを生成するためのスクリプトが提供されています。 ・高い柔軟性:もともとHAPLOINSUFFIONの遺伝子とセグメントの重複を表示するために開発されましたが、ゲノム内の興味深い空間的関係を持つ任意の特徴を表すために使用できます。 要件: ・Java 1.6以降


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