ピラックス

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ピラックス ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • BSD
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Sargis Dallakyan
  • 出版社のWebサイト:
  • http://mgltools.scripps.edu/Members/sargis
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X
  • ファイルサイズ:
  • 118.9 MB

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ピラックス 説明

このツールで分子データを表示します PYRXは、潜在的な薬物標的に対して化合物のライブラリーをスクリーニングするために使用できる計算創薬のために特別に設計された、使いやすい仮想スクリーニングアプリケーションです。 PYRXは、薬学薬品が仮想的なスクリーニングフォームを実行することを可能にし、このプロセスのあらゆるステップでユーザーを助け、データの準備からジョブの提出と結果の分析に役立ちます。創薬プロセスにマジックボタンがないことは事実ですが、PYRXはそれをコンピュータ支援ドラッグデザインのための貴重なツールにする使いやすいユーザーインターフェースを備えたドッキングウィザードを含みます。 PYRXはまた、合理的な薬物設計に不可欠な化学スプレッドシートのような機能性および強力な可視化エンジンも含まれています。このリリースの新機能: ・データベーステーブル用のコンマ区切り値(CSV)ツールとして保存を追加しました。 ・データベーステーブルのプロット機能を追加しました。この機能は、タブの下のツールバーボタンを介してアクセスできます。デフォルトでは、結合エネルギー対リガンド(指数)のバープロットが示されているテーブルプロットダイアログを開きます。 Pubchem BioAssayが開いているCVSボタンを使用して開いた場合、このウィジェットはその表に結果列があるかどうかを確認します。 。 ・UFFからMMFF94へのオープンベイブエネルギーの最小化のためのデフォルトの力フィールドを変更しました。 ・中(ga_num_evals = 2500000)から短いエネルギー評価の最大数(AutoDockの汎用アルゴリズムパラメータ)のデフォルトを変更しました(GA_NUM_EVALS = 250000)。 ・AutoDock PBSジョブ送信の進捗状況を追加しました。 ・ドッキングした立体配座の分子表面を表示する際に問題を引き起こしていた虫を修正しました。 ・AutoDock用のマクロ分子ファイル(PDBQT)を作成するときに、代替のコンフォメションを選択するダイアログを追加しました。 ・ユーザーからバグレポートやコメントを取得するために使用できる最新のQuality Agent。 ・AutoRid Webサービスのキャンセルオプションを追加しました。 ・オートドッコ用の柔軟な残渣を実装しました。この機能は、ナビゲータ - >分子の下の残渣を選択して、それらを右クリックすることでアクセスできます。 AutoDock - >柔軟な残留物を選択して、Receptor PDBQTおよびFlex.PDBQTを使用して、ナビゲータ - > AutoDock - >高分子の下にある_Flexフォルダを作成します。この受容体への全てのドッキングは、この柔軟な残基を用いて行われる。 ・Pythonをバージョン2.6に更新し、ETSを3.4.0にします。


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