| 減らす タンパク質データバンク(PDB)分子構造ファイルに水素を添加するためのフリーアプリケーション |
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- http://kinemage.biochem.duke.edu/software/probe.php
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タンパク質データバンク(PDB)分子構造ファイルにヒドロゲンを追加するための無料アプリケーション 還元は、タンパク質データバンク(PDB)分子構造ファイルに水素を添加するための無料アプリケーションです。 ヒドロゲンは、OH、NH 3、SH、ASN、Metメチル、およびGLNサイドチャインアミドの配向の最適化を伴って標準化された幾何学的形状に添加され、そしてその環は処理され得る。 HETグループは、原子接続性が提供されている限り処理することもできます。 PDBによって公開された接続テーブルのわずかに修正されたバージョンは以下の通りです。 HET辞書は2つの「フレーバー」 - 新旧で利用可能です。 どちらを使用するかは、出力として希望する縮小PDBの種類に依存します。
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