普遍的な

システム生物学コード変換ツール
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普遍的な ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • MIT License
  • 出版社名:
  • Jeffrey Varner
  • 出版社のWebサイト:
  • http://code.google.com/u/105953072772446189322/
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X 10.6 or later
  • ファイルサイズ:
  • 21.1 MB

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普遍的な 説明

Universalは、さまざまな入力フォーマットから数学モデルコードを複数の出力フォーマットのうちの1つに生成するための無料でオープンソースのクライアントサーバーのJavaツールです。 たとえば、入力フォーマットでは、コンマ区切りフラットファイルはユニバーサルで読み取られ、サーバー上のメモリ内のシステム生物学マークアップ（SBML）ツリーに変換されます。 SBMLツリーから、モデルコードはCプログラミング言語（GSL、SunDials、またはOctave Cモジュール）またはMATLAB Mコード、OCTAVE MコードまたはSCILABで生成されます。 さらに、拡張可能なので、ネットワークの視覚化のための、例えばSBMLからGraphVizドットフォーマットのような数のプラグインモジュールが開発されている。 ユニバーサルグラフィカルユーザーインターフェイス（GUI）とコード生成エンジン（CGE）の両方を含みます。 GUIはObjective-C / Cocoaで書かれていますが、CGEはJavaベースです。


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