魔ma

再配置ゲノム配列のグローバル多重アラインメントを構築する
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魔ma ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • Aaron Darling
  • 出版社のWebサイト:
  • http://genome-alignment.org/mauve/
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X 10.3 or later
  • ファイルサイズ:
  • 14.2 MB

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魔ma 説明

再配置されたゲノムシーケンスのグローバルな複数のアラインメントを構築します Mauveは、再配置および反転などの大規模な進化イベントの存在下で複数のゲノムアライメントを効率的に構築するためのシステムである。複数のゲノムアラインメントは、比較ゲノミクスの研究のための基礎と新しい規模での進化的動力学の研究を提供します。全ゲノムを整列させることは、短シーケンスの整列を整列させることよりも根本的に異なる問題である。マルチゲノムアライナは、適度な計算資源だけを必要とするという考えで開発されてきた。 Mauveは、整列されている配列の量でよくスケジュールするアルゴリズム技術を採用しています。例えば、一対のY.ペステスゲノムを1分以内に整列させることができ、一方、9分間の群のグループは数時間で整列させることができる。このリリースの新機能: 新機能: ・Mac OS Xの古いバージョンとの互換性 バグが修正されました: ・SNP出力は現在のケースシーケンスファイルとギャップ文字を処理するようになりました ・アライナのメモリの使用量は合理化されており、多くのゲノムとのアライメントのためのメモリ要件が減少しました。 ・コマンドラインでGenbankフォーマットドラフトゲノムを並べ替えることを防止したバグを修正しました ・マムを生成するときにクラッシュを修正しました ・ギャップを含むシーケンスを入力として使用した場合のエラーを報告する ・Orostog Alignment Outputで追加の改行を削除します ・OpenJDK Rectangle Drawingバグを修正しました


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