密閉 SE - Al - ヌクレオチドおよびアミノ酸配列からの複数の配列アラインメントを作成するための適用
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SE-Al - ヌクレオチドおよびアミノ酸配列からの複数の配列アラインメントを作成するための適用 SE - ALは、ヌクレオチドおよびアミノ酸配列から複数の配列アラインメントを作成するための適用である。現時点では、自動的なアラインメントをしていないが、手のアラインメントの製造およびPhylipおよびPaupSe-ALなどの系統発生プログラムなどの整列プログラムのための入力を準備するためのものである。 / RNAシーケンス。該当なしの一般的に使用されている形式のシーケンスのインポートとエクスポートの重要な機能です。現時点では、Nexus、Phylip、Mega、NBRF、FASTA、GDE、GDEフラットフォーマットがサポートされています。フォーマットが明確に定義されていないか、または煩わしくできなかったため、これらのフォーマットのいくつかは信頼できません。インポートに失敗したファイルで私に電子メールを送ります。・タンパク質コード遺伝子のヌクレオチド配列の場合、ユーザーは3モードを自由に切り替えることができます：ヌクレオチド - 単一のベースのレベルでの位置合わせを編集します。コドンの編集様々な遺伝的コードを使用して翻訳された推定アミノ酸の整列を編集する（このモードで行われた編集は、実際には、アミノ酸の配向を可能であるがヌクレオチドとしての輸出を可能にする元のヌクレオチド配列に対して行われる）。読み取りフレームをシフトし、反転および補完はすべて、任意のシーケンスとは無関係に行うことができます。・アラインメントは、シーケンスのブロックを選択し、他のシーケンスに対してそれをスライドさせることで編集できます。ギャップはブロックの後ろに開きます。これらの変更は元に戻すことができます。・シーケンスとそのラベルは別のウィンドウで編集できます。 RAWシーケンスは、このウィンドウに他のソース（GenBankテキストファイルや電子メールなど）から貼り付けることもできます。スペース、配合文字、非シーケンス文字（数字など）は自動的に削除されます。・コンセンサスシーケンスは配置の上に表示できます。・アラインメントは、急速な開放と変換の保全を可能にする2進形式で保存されます（つまり、読み書き、補完）。または翻訳）が使用されていた。・配列全体または配置の区間を切り、コピー、貼り付ける。 Nexus形式のSE-ALとその他のアプリケーションをコピーして貼り付けます。・ウィンドウのドラッグアンドドロップウィンドウまたはNexusフォーマットの他のアプリケーションにドラッグアンドドロップします。・所定のシーケンスと同様のモチーフまたは領域を検索する（現時点では非常に原始的） ）。

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