CCDEEP クロマチンコンフォメーションディープ分析
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CCDEEP 説明

クロマチンコンフォメーションディープ分析（CCDEEP）ツールを使用すると、HI-C実験からのクロマチン立体配座配列決定データを分析することができます。 CCDeepはいくつかの要因に基づいてデータを処理できます。 ・選択された制限酵素部位からの遠隔マッピングまたは低いマッピング性を有する領域へのそれらの付着に基づいて、低品質のシーケンスを除去する ・列挙および定量化（生、正規化）の一対のフラグメント終了を生成する ・バイアス定量化の可視化（GC含有量、フラグメント長、マッピング性）を要約する Mac上のCCDeepユーティリティをインストールして使用する方法の詳細な手順は、ここで入手できます。 CCDEEPはクロスプラットフォームであり、Mac OS XとLinuxで動作します。 Linuxプラットフォーム用のバイナリは、プロジェクトのホームページで入手できます。

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