CLCメインワークベンチ バイオインフォマティクスプログラム。
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CLCメインワークベンチ 説明

高度タンパク質およびDNA配列分析のためのバイオインフォマティクスプログラム CLCメインワークベンチの完全機能デモのこの2 x 2週間のCLC遺伝子ワークベンチのすべてのDNA配列分析およびCLCタンパク質Workbench.CLCのすべてのタンパク質配列分析のすべてのDNA配列分析は、すべての分析を1つの単一の単一、ユーザーフレンドリーに統合するツールです。そして直感的なソフトウェアアプリケーション。 "CLC Main Workbench"の主な機能はいくつかあります。 ・DNAシーケンスデータの組み立て。 ・高度なプライマーデザイン。 ・分子クローニング ・シーケンスの自動SNPアノテーション。 ・二次タンパク質構造予測 ・統合3D分子ビュー。 ・信号ペプチド予測（SignalP） ・膜貫通ヘリックス予測（TMHMM）。 ・タンパク質ファミリー分析（PFAM）。 ・2種類のアラインメント。 ・系統発生薬。 ・モチーフ検索（既知のパターン）。 ・パターン発見（不明パターン）。 ・ブラスト。 ・1回のワークステップにおける複数解析のバッチ処理。 ・ドットプロット。 ・疎水性解析 ・抗原性分析 ・GenBank、Swissprot、Trembl、およびPubMedを検索します。 ・行ったアクション/解析の詳細なログ。 要件： ・256 MBのRAMが必要です。 ・512 MB RAMをお勧めします。 ・1024 x 768ディスプレイ推奨。 制限事項 ・4週間の完全に機能的な試用期間。このリリースの新機能： 発現分析： ・火山プロット：X軸にプロットする値を選択できます。 「差分」と「倍数変化」を選択してください。続きを読む... ・バープロットの表ビューは、バープロットに表示されているのと同じ間隔を示しています。 ・表形式の表現配列データの一般的なインポーター。続きを読む... ・表現実験用の汎用インポーター表形式でのデータ。続きを読む... ・遺伝子オントロジー（GO）ファイルを使用して発現実験に注釈を付けることができます。続きを読む... ・タグプロファイリング：タグサンプルの注釈、実験のみを注釈にすることはできません。 ・実験表のサイドパネルは、概要を提供するように再編成されています。続きを読む... ・ギャップを含むコンセンサスシーケンスを開くと、コンセンサスシーケンスが開始され、終了後にNSが表示されます。 展開： ・ワークベンチが初めて起動したときに使用されるデフォルトのデータ場所へのパスを設定できます。これは、システム管理者がデフォルトあたりの新しいインストールがそれらのデータを保存するのを制御するのに役立つ機能です。続きを読む... ・インターネットにアクセスするツールの削除（NCBI Blast、Update Notificationsなど）のサポート。続きを読む... 一般的なインポートとエクスポート： ・GFFファイルからの複雑な領域のインポートのサポート ・エクスポートテーブルとレポートをExcel形式で。 ・ユーザーマニュアルのインポート・セクションは、より良い概要を提供するように再構築されました。詳細を読む....式データインポーターは、別のセクションの技術的な詳細で説明されています。続きを読む.... ・FASTA形式で複数のシーケンスリストをエクスポートできるようになりました ・ZIPファイルの強制インポートがサポートされるようになりました（ZIPファイルの内容を強制的にインポートされます） ・標準インポートはZIPと同様にgzipとtarファイルを受け入れるようになりました ・強制インポートが失敗した場合は、何が問題になったのかについてより技術的な情報があり、インポートファイルの不正なフォーマットを識別できるようになります。 ・GenBank社の輸入業者の両方が、遺伝子名を持たない遺伝子の命名命令でいくつかの試みをします。それは繰り返し次の修飾子を試してみてください： "product"、 "locus_tag"、 "transcript_id"と "transcript_id" ・記載されている長さが実際のシーケンスと一致しないGenbankファイルをインポートする場合は、警告が表示されますが、シーケンスは受け入れられます。 ・CSV形式でエクスポートするときは、ロケール設定を使用してコンマまたはセミコロンを区切り文字として使用する必要があるかどうかを判断します（米国のロケールに使用されるコンマ） ・GFFプラグインは複雑な注釈を受け入れるように更新されました その他： ・注釈テーブルを使用した注釈の高度な再定型化。続きを読む... ・フルディスクがデータの保存を妨げる場合の状況の報告の改善 ・検索テーブルからドラッグアンドドロップを使用してシーケンスのダウンロードは、フォルダ内の「ダウンロード...」ノードを作成しなくなりました。プロセスタブでダウンロードプロセスを監視できます。 ・プライマー設計は5000 bpより長いPCRフラグメントをサポートするようになりました。 ・ファイルMANUからToolbox-> General Sequence Analysisに移動した列を抽出します。続きを読む... ・さまざまなダイアログに関する進捗状況の向上 バグの修正： ・データをコピーしてからフォルダの更新時に「コピー...」ラベルを表示する問題を修正しました ・タブの命名に関する問題を修正しました。 修正方法は、WindowsとLinuxでは保存されていないデータがTAB名を太字と斜体にするのではなく*を取得するようになりました。 （これは常にMac OS Xの動作でした）。

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