CLC RNAワークベンチ 高度なRNA配列分析のためのバイオインフォマティクスプログラム。
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CLC RNAワークベンチ 説明

高度なRNA配列分析のためのバイオインフォマティクスプログラム CLC RNA Workbenchは、ユーザーが複雑なアルゴリズムとオプションの範囲に簡単にアクセスできます。 RNA二次構造は、最先端の自由エネルギー最小化アルゴリズムを使用して予測することができる.CLC RNAワークベンチは、高度なRNA配列分析のためのバイオインフォマティクスプログラムである。すべての分析は、1つの直感的でユーザーフレンドリーなソフトウェアアプリケーションに完全に統合されています。 "CLC RNAワークベンチ"の主な機能はいくつかあります。 ・二次構造予測 ・二次構造のグラフィカルビューと編集。 ・構造とエネルギーの寄与の表形図。 ・シーケンスビューのシンボリック表現。 ・パターン検索。 ・ブラスト検索 ・一般的なシーケンス分析。 ・ヌクレオチド分析。 ・シーケンスアライメント。 ・ドットプロット。 ・仮想ゲルビューア。 要件： ・256 MBのRAMが必要です。 ・512 MB RAMをお勧めします。 ・1024 x 768ディスプレイ推奨。 制限事項 ・4週間の完全に機能的な試験。このリリースの新機能： 展開： ・ワークベンチが初めて起動したときに使用されるデフォルトのデータ場所へのパスを設定できます。これは、システム管理者がデフォルトあたりの新しいインストールがそれらのデータを保存するのを制御するのに役立つ機能です。続きを読む... ・インターネットにアクセスするツールの削除（NCBI Blast、Update Notificationsなど）のサポート。続きを読む... 一般的なインポートとエクスポート： ・GFFファイルからの複雑な領域のインポートのサポート ・エクスポートテーブルとレポートをExcel形式で。 ・ユーザーマニュアルのインポート・セクションは、より良い概要を提供するように再構築されました。詳細を読む....式データインポーターは、別のセクションの技術的な詳細で説明されています。続きを読む.... ・FASTA形式で複数のシーケンスリストをエクスポートできるようになりました ・ZIPファイルの強制インポートがサポートされるようになりました（ZIPファイルの内容を強制的にインポートされます） ・標準インポートはZIPと同様にgzipとtarファイルを受け入れるようになりました ・強制インポートが失敗した場合は、何が問題になったのかについてより技術的な情報があり、インポートファイルの不正なフォーマットを識別できるようになります。 ・GenBank社の輸入業者の両方が、遺伝子名を持たない遺伝子の命名命令でいくつかの試みをします。それは繰り返し次の修飾子を試してみてください： "product"、 "locus_tag"、 "transcript_id"と "transcript_id" ・記載されている長さが実際のシーケンスと一致しないGenbankファイルをインポートする場合は、警告が表示されますが、シーケンスは受け入れられます。 ・CSV形式でエクスポートするときは、ロケール設定を使用してコンマまたはセミコロンを区切り文字として使用する必要があるかどうかを判断します（米国のロケールに使用されるコンマ） ・GFFプラグインは複雑な注釈を受け入れるように更新されました その他： ・注釈テーブルを使用した注釈の高度な再定型化。続きを読む... ・フルディスクがデータの保存を妨げる場合の状況の報告の改善 ・検索テーブルからドラッグアンドドロップを使用してシーケンスのダウンロードは、フォルダ内の「ダウンロード...」ノードを作成しなくなりました。プロセスタブでダウンロードプロセスを監視できます。 ・ファイルメニューからToolbox-> General Sequence Analysisに移動した列を抽出します。続きを読む... ・さまざまなダイアログに関する進捗状況の向上 バグの修正： ・データをコピーしてからフォルダの更新時に「コピー...」ラベルを表示する問題を修正しました ・タブの命名に関する問題を修正しました。修正方法は、WindowsとLinuxでは保存されていないデータがTAB名を太字と斜体にするのではなく*を取得するようになりました。 （これは常にMac OS Xの動作でした）。

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