MPEX ランキングとまとめ
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- http://blanco.biomol.uci.edu
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MPEX 説明
膜タンパク質のトポロジーを探求するためのツール MPEXは、熱力学的および生物学的原則に基づくヒドロパチー陰性プロットによって膜タンパク質のトポロジーおよび他の特徴を探求するための自由で使いやすいツールであり、MPEXは、KyteとDoolittleによって普及したヒドロパチープロット法を用いた膜タンパク質配列の検査のために設計されています。 (1982)。すなわち、アミノ酸配列の物理的または統計的性質を表す数字の配列としてのアミノ酸配列を表す滑り窓分析に基づく。最も一般的な物理的性質は、水と膜の間のアミノ酸の分配の自由エネルギーに基づく水素症です。このバージョンのMPEXは、2種類の水素化症スケールを使用しています:この実験室および実験ベースの生物学的分配スケールで決定された実験ベースの全残留分配スケールは、ストックホルム大学のVon Heijne Laboratoryと共同で決定されます。要件: ・Java 1.6以降
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