| MSATCommander このオープンソースアプリケーションは、マイクロサテライトの繰り返し、設計特定のプライマーを設計し、それらをタグにタグを付けます。 |
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MSATCommander ランキングとまとめ
- 出版社のWebサイト:
- http://code.google.com/u/faircloth/
- オペレーティングシステム:
- Mac OS X 10.4 or later
MSATCommander タグ
MSATCommander 説明
このオープンソースアプリケーションは、マイクロサテライトの繰り返しを見つけたり、遺伝子座固有のプライマーを設計したり、タグを付けたりするのに役立ちます。 MSATCommanderは、Microsatellite(SSR、VNTR、C)を見つけるために書き込まれたPythonプログラムです。 MSATFINDERは、すべてのDI-、TRI - 、TETRA-、PENTA-、およびHEXA - ヌクレオチドの反復を検索する(繰り返しタイプをより少ない繰り返しタイプおよび繰り返しタイプの組み合わせを検索するためのオプションを使用して).MSATCommanderはまた、プライマーをプライマーとして使用してプライマーをタグおよびデザインする。 デザインエンジン。 ここに「MSATCommander」の主な機能があります。 ・全てのモノ - 、ジ - 、トリ - 、テトラ - 、ペンタ - 、およびヘキサヌクレオチドの繰り返しの検索 ・繰り返しは、ユーザー指定の距離にわたって組み合わせることができます(BP) ・配置された繰り返しのためのプライマーを設計する ・M13R、CAG、またはカスタムタグ付きのプライマーをタグとテストします。 「最良の」プライマーがユーザーに報告されます ・多数のユーザーのための便利なGUIを提供します ・スプレッドシートソフトウェアを簡単にインポートするために、CSV形式の出力を出力します。
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