| | RDP分類器ドメインから属への分類学的課題を迅速かつ正確に提供することができるナイーブベイジアン分類器 |
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RDP分類器 説明
ドメインから属への分類学的課題を迅速かつ正確に提供することができる素朴なベイジアン分類器 RDP分類器は、RRNA配列データに基づく迅速な分類学的配置を提供するために開発されたナイーブベイジアン分類子である。 RDP分類器は、Bergeyの信頼によって提案された新しい高次分類法に細菌16S rRNAシーケンスを迅速かつ正確に分類することができる。それはドメインから属に分類学的割り当てを提供します.RDP分類器は、Bergeyの編集者によって提案されたバクテリア分類学の使用に限定されません。 NCBI分類法で訓練されたときにも同様にうまくいきました。 RDP分類器は、追加の系統発生的にコヒーレントな細菌分類学的分類法に適合させる可能性がある。 RDP分類器は、Garriity ETによって提案された新しい系統発生的に一貫した高次の細菌分類学に16S rRNA遺伝子配列を容易に割り当てることを可能にするであろう。 AL.Hierarchical Taxaは、ナイーブベイジアンRRNA分類器に基づいています。新しく訓練された分類器は、細菌および古細菌の両方のrRNA配列の分類を可能にする。このリリースの新機能： ・以前のリリースでは、有効な単語のないシーケンスを分類します。 ・新しい変数min_good_wordsを要求し、それをmin_seq_len - sequence.wordsizeに設定するように変更されました。
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