TreeBuilder3D 遺伝子表現のためのフリービュー
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TreeBuilder3D 説明

遺伝子発現のための無料の眺め TreeBuilder3Dは、階層的樹状図にマイクロアレイ、又はpheneticネットワークとしてSAGE遺伝子発現データの他のタイプの組織化を可能にフリーでオープンソース、インタラクティブビューアである（分析として使用される用語「phenetic」は系統発生解析に用い、プリンシパルに依存していますベンdiagrams.Using TreeBuilder3Dする代わりに、プレーンテキストファイルの形式で発現データをロードすることが可能となる可能としてSAGEライブラリの発現プロファイルの違いを分析する際、システム生物学による）.TreeBuilder3Dが視覚的補助として使用することができ、機能し、仮説ツリー状の図、（例えばSAGEライブラリなど）異なるデータセット間の「進化」の関係を記述する築きます。このような図は1に遺伝子発現データの階層的な組織についてのアイデアを与える、とあなたは（癌などの）異なる細胞状態または死亡の中間段階で（SAGEライブラリまたはマイクロアレイ実験によって表される）、様々な発現プロファイルを関連付けることができる場合があります【選択のグループ化TreeBuilder3Dのアルゴリズムは、一般に、類似の発現プロファイルグループにPearsonおよび他のメトリックを使用している他のクラスタリング法に用いられるものと同様です。それらとは異なり、TreeBuilder3Dの可視化は、グループ化するだけでなく、データセットやプレゼント間の相対距離方法を「遠く」またはどのように「閉じる」発現プロファイルは、相互にある知識。それは、3Dのデータで動作するように加えて、TreeBuilder3Dを効率的にデータセット間正しくスケーリングの距離を表示する可能性を与え、2次元空間の制約を除去します。要件： ・Java 1.4以降

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