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遺伝子セットのための濃縮転写因子を検出するためのソフトウェア Cheaは、一組の遺伝子に対する濃縮された転写因子を検出するために使用できるデータベースを持つ無料のソフトウェアツールです。 最初のステップでは、いかなる転写因子のターゲットではないすべての遺伝子が入力リストから除去されます。 したがって、以下の分析は、潜在的なTFターゲットである残りの遺伝子に対してのみ実行される（これには、画分の計算を含み、セクションC、5を参照）。 各TFには、バックグラウンドデータベース内のそのターゲットのサブセットである遺伝子のセットが割り当てられています。 Fisher Exact Testを使用することで、入力リストの各TFの重要度を測定するP値が計算されます。 このアプローチは、背景データベースと入力遺伝子リストからの逸脱を検出します。 要件： ・Java 1.6以降
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