flagdb ++

植物ゲノム周辺の統合データベース
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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 価格:
  • FREE
  • 出版社名:
  • FLAGdb Team
  • 出版社のWebサイト:
  • http://urgv.evry.inra.fr/projects/FLAGdb++/
  • オペレーティングシステム:
  • Mac OS X
  • ファイルサイズ:
  • 1 KB

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flagdb ++ 説明

植物ゲノム周辺の統合データベース FlagDB ++は、Javaプログラミング言語で書かれた自由なプラントゲノムビューアです。モデルプラントのゲノムは、生成されたすべての情報を収集してマージするため、機能予測を最適化するための物理的な参照として使用されます。実際、大量のデータの生物学的解釈は、それらの統合、組織および視覚的表現を必要とする。染色体シーケンスの周囲のデータを整理することは、情報および参考文献の冗長性を減少させることを可能にするが、シンテニチおよびゲノム進化の概念および構造と遺伝子の機能との関係を容易に研究することを可能にする。この一般的な概観の概要は、遺伝子の機能的研究と、特に生理学的状態の遺伝子の関係のパターンを考慮して、遺伝子の機能的研究が可能になるでしょう。したがって、このプロジェクトの最終的な目的は、植物完全なゲノムの選択周辺のゲノムデータの統合に基づいてデータベースおよび関連するバイオインフォマティクスツールを開発することです。要件: ・Java 1.4以降 このリリースの新機能: ・シロイヌナズナとライスゲノムの更新とその注釈 ・Vitis 12xゲノムと注釈の統合 ・Vitisゲノムのユージーン注釈 ・系統発生プロファイルの統合 ・新しいシロイヌナズナFSTとGST ・すべてのトランスクリプトリソースの更新(ESTとcDNA) ・予測シロイヌナズナの統合 ・オルソロジーの関係に捧げられた新しいツールとインタフェース ・細胞内局在化、遺伝子ファミリ分類および相互参照の更新


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