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jmotu ランキングとまとめ
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- ライセンス:
- Freeware
- 出版社名:
- Mark Blaxter
- 出版社のWebサイト:
- http://www.nematodes.org/
- オペレーティングシステム:
- Mac OS X
- ファイルサイズ:
- 7.5 MB
jmotu タグ
jmotu 説明
Barcode DNA配列データを分子運用分類様式単位にクラスタリングするためのソフトウェア（MOTU） Jmotuは、バーコードDNAシーケンスデータを分子運用分類学的単位（MOTU）にクラスタリングするための無料で使いやすいソフトウェアパッケージです。 JMotuは大きなデータセットを処理し、実行する必要がある正確なグローバルアラインメントの数を最小限に抑えるために一連のフィルタリングステップを使用できます。 ペアワイズ距離を計算するとき、JMOTUはギャップを無視し、ヌクレオチドの誤差のみをカウントし、ホモポリマーの実行によって引き起こされる除去エラーを比較的堅牢にします。 クラスタリングは、入力シーケンスの順序に依存しない貪欲アルゴリズムを使用して実行されます。 JMotuは約50,000の入力シーケンスの生データセットでテストされており、グローバル分析のためにそれらを組み合わせる前に、データのサブセットのプラクラスタリングを可能にすることによって大きなデータセットをクラスタ化することができます。
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