orfprimer. ORFPRIMER - 自動プライマーデザイン用のJavaアプリケーション
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順序 プライマー プライマーデザイン PCRプライマーを計算します シーケンスを保存します PCR.

orfprimer. 説明

ORFprimer - 自動的なプライマー設計のためのJavaアプリケーション ORFprimerは、自動的なプライマーの設計のためのJavaアプリケーションです。これは、GenBank XML-とfasta-シーケンスフォーマットを読み込み、当社の以前にリリースされたソフトウェアORFerに基づいています。タンパク質配列は、典型的には、単に、対応するタンパク質標的のGI識別子またはアクセッション番号を指定してダウンロードされます。 ORFerは、要求されたタンパク質配列からのオープンリーディングフレームを抽出し、表示it.ORFprimerは自動的にこれらの配列のためのPCRプライマーを算出します。 ORFprimerの取り扱いは、デフォルトの設定を使用して、直感的かつ非常に簡単です。加えて、計算オプションを変更するための多くの可能性を提供する前に、また、そのようなプライマーとして、の演算後：・プライマー位置のずれ、・所望の融解温度の変化、・プライマーsequences.Thisにおける制限部位の変化道ORFprimerはそれをtool.ORFprimerはローカルSQLデータベースで検索したシーケンスを記憶することを可能にするデータベース・インターフェースを提供する強力なソフトウェアを作る一つのプログラムで適応性と利便性を兼ね備えています。このデータベースはORFprimerインストールパッケージのスクリプトを使用して設定することができます。現時点でのMySQL、OracleとMicrosoft Accessが「ORFprimer」のある主要特点supported.Hereされている：簡単な使用方法：・ORFprimerはほとんど自明である。・グラフィカル・ユーザー・インターフェース（GUI）がhandling.Compatibilityをsimplyfies：・ORFprimerが実装されましたWindowsやLinux、Macの、Unixの、...オンラインのアクセシビリティ：Javaで・ORFprimerがORFprimerが異なるマシン上で実行することができます。・プラットフォームに依存しないでにJava Web Startテクノロジは、インターネットを経由してORFprimerを開始することを可能にする明示的なダウンロードとインストール手順はありません必要。データ管理：・ORFprimer独自のデータベースをセットアップするためのツールが含まれています。・並行（MySQLやOracleとMicosoftアクセス）がサポートされています。・また、データをファイルに書き込むことができる（例えばFASTA形式）.Highスループット計算：。。・ORFprimer缶標的配列の数千人までのためのコンピューティングプライマーを使用すること。・この手順では、テキストファイルを通じて目標を読み取ることによって、さらに自動化することができます。

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