phort 系統の木を並べ替えるためのオープンソースの解決策
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系統の木を並べ替えるためのオープンソースソリューション PhyloSORTは、運用分類学的単位（OTUS）によって定義された関心のある興味のある興味のあるグループを含むユーザ指定のサブツリーを検索することによって系統発生系統を並べ替えるためのオープンソースのJavaツールである。 ：・排他的モードでは、クエリグループからのタシアがツリーに存在し、そのクレードを修飾し、ツリーをマッチツリーとして考えるためにMONOPHYLEC CLADE内に配置する必要があります。・包括的なモードではそのクエリタチュアからの追加のタプセットが、そのクレードの外側の木のどこかにあるかどうかにかかわらず、排他的モードの制限は緩和される。これが「Phylosort」のいくつかの重要な機能です： ・分類群のグループ間の単視関係を探す。 ・MONOPHYLEC用包含に関連するブートストラップサポート値によるフィルタリング。 ・木の複雑さによるフィルタリング（木の分類数）。 ・家族の複雑さによる濾過（木のタキソンあたりの遺伝子数）。 ・木のクラスター（遺伝子ファミリー）への木（遺伝子）をクラスター化する。 ・分類法の参照ツリーを使用してOTUSをグループ化する。 ・ニュミック解析、ツリートラバース、再起動などのツリーデータ構造を操作するための一般的な手順の清潔で再利用可能な実装。 ・ツリービューア（ATV）を使用したツリートポロジの視覚化。

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