vmtk 血管の3D再構成に使用できるプログラム
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血管の3D再建に使用できるプログラム VMTKは、画像ベースの血管モデリングにおける3D再構成、幾何分析、メッシュ生成および表面データ分析のための図書館およびツールで構成されています。これが "VMTK"の主な機能です。 医用画像からの血管セグメント（または他の解剖学的構造）のセグメンテーション： ・グラデーションベースの3Dレベルセグメンテーションを設定します。湧風有限差に基づく新しい勾配計算モダリティは、小さい（1.2ピクセル/直径）容器のセグメンテーションを可能にする。 ・インタラクティブレベルは、高速マーチング方法に基づく初期化を設定します。これには、2つの点の間で構成される血管セグメントを自動的に無視するためのブランドの新しい方法が含まれます。複雑な血管路をセグメント化するために枝の終点を選択して、唯一の進歩期間をオンにした状態で勾配ピークを引き付け、すべての分岐の操作を繰り返し、すべてのモデル内のすべてのモデルをマージすることによってレベルセットを可能にします。 血管（および一般的な管状物）の3Dモデルの幾何分析と表面データ処理（（主要なアルゴリズムは医用撮影ジャーナルに公開されています。David Steinman's and Luca Antigaのホームページでの出版物への完全な参照を見つけることができます））： ・それらの多角形表面表現を考えると、中心線および最大内接の球体構造の半径を計算する ・中心線の形状に基づいて表面モデルを構成分岐に分割する ・中心線ベースの幾何学的量（分岐角、平面性、対称性、分岐曲率、屈曲度など）および表面ベースの幾何学的数量（中心線までの距離、表面曲率、狭窄から最大刻まれた球への偏差など） ・長方形のパラメトリック空間への堅牢に分岐します ・個体群に対する幾何学的データとCFDデータの統計分析のためのパラメトリックマッピングに基づく矩形パッチを生成します。 スクリプト、I / Oツール、および簡単に画像やメッシュを簡単に処理するための簡単なアルゴリズム： ・数の画像、表面、ボリュームメッシュフォーマットを読み書きする。オートフリッピング機能、Netgen Meshフォーマットリーダー、LibMesh XDAメッシュフォーマットライタ、TETGENメッシュジェネレータラッパー、FIDAP FDNEUTメッシュフォーマットリーダーとライターとNewTetR入力ファイルジェネレータのDICOMシリーズリーダーが含まれています。 ・画像やメッシュを表示します ・複数のVTKクラスを切り替えて、それらをPipeableスクリプトとして利用できるようにします。行進キューブ、表面平滑化、クリッピング、通常の計算、（接続性、細分、表面間の距離、ICP登録） ・CFDシミュレーションの前処理ステップとして、表面モデル境界に円筒形の拡張を追加します。 ・CFD用の厚さを変えるプリズム要素の境界層を発生させる このリリースの新機能： ・フロー拡張生成のバグを修正しました ・改良された表面の再調整の改善 ・Windowsコンパイルの問題を修正しました ・64ビットのコンパイルの問題を修正しました ・最後に（Michalisによる偉大な初期貢献、HugoとJOPPEによる後のヘルプのおかげで）MSHファイルへの流暢なエクスポートは正しく機能し、境界指標を正しく保持します。これにより、OpenFOAMでVMTKメッシュを使用することもできます。 ・DolfinとLifevメッシュライターが固定され改善されました ・ラジアル基底関数補間を追加しました ・中心線+半径からチューブの効率的なモデル化を追加 ・新規血管機能強化方法を含んでいました ・VMTKに移植された高速血管ネットワーク分析アルゴリズム（My PhD論文を参照） ・リニアメッシュの二次投影は、ネガティブのヤコビアンの完全なチェックを行う ・HUGOから貢献したCURVED MPRクラスとスクリプトを追加しました（VMTKIMagesShiftscale、VMTKSurfaceTransformEnteractiveおよびVMTKSurfacetransformerActiveおよびVMTKeurFacetransformとVMTKimagerSliceSlice - それらをチェックアウトする！） ・Centerline Mergingを追加しました ・分岐プロファイルの抽出を追加しました ・混合メッシュ用の四表層スクリプトを追加しました

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