 | ぴちぴち保守的および根本的な非同義の距離を計算するための方法 |
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ぴちぴち 説明
オン新規出願は、タンパク質コードDNA配列間の保存的およびラジカル非同義の距離を推定するために設計された。この方法は、遷移バイアスを考慮して、HUGHES、OTA、およびNEI（1990）の元の方法から修正される。 3種類のアミノ酸分類（電荷、極性および宮田および安賀県）が提供される。保存的およびラジカルアミノ酸の変化を自分で定義することもできます。 群間の変化が根本的で群内であるように、アミノ酸基を定義することができる。それを行うには、self.divという名前のファイルを作成します。このファイルでは、第1の線はアミノ酸の群であるべきである（例えば、充電の場合、3つの基がある）、第2の線は第一群のアミノ酸の数である。群内のスペース、およびアミノ酸。 アミノ酸の1文字コードを使用する必要があります。次の行は2番目のグループのための情報になります。最後のグループが最初のN-1グループの情報から派生できるため、最初のN-1グループの情報を入力するだけでよい。
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