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マスコロコ 説明
MASSCHROQは、液体クロマトグラフィー - 質量分析法（LC - MS）技術から得られたデータ上の定量化を行う特殊および用具である。 MASSCHROQは、アラインメント、XIC抽出、ピーク検出を実行するためにも使用できます。 さらに、MASSCHROQを以下のものに使用できます。 ・高分解能分光計システムの両方から得られたデータを分析する。 ・ラベルフリーおよび同位体標識データ（例えば、Silac、Icat、N-15、C-13など）を分析する。 ・ワンショットで大量の異なる分析されたサンプルを時間効率的に処理します（類似のサンプルをグループ化し、各グループの分析をパラメータ化する可能性を提供します）。 ・LC-MS分析の前のペプチドまたはタンパク質分別として複雑なデータ治療を考慮に入れる（SCX、SDS-PAGEなど）。 主な特徴： MZXMLとMZML LC / MSデータフォーマットの解析 サンプルの全ての同定されたペプチドおよび/または所与の質量（M / Z）値および/または与えられた（M / Z、保持時間）値の一覧。 識別されたペプチドは、当社のX！タンデムパイプライン（MastChroqMLフォーマットでの結果を識別およびエクスポートする）または他の識別ソフトウェアから得られた識別結果を含むTSV（タブ区切り値）ファイルを使用することによって、MassChroqの分析に自動的に統合できます。 。 2つのアライメント方法があります.MSレベル1のデータに基づくサードパーティの帯状ワープアライメントはMASSCHROQに統合され、In社内はMSレベル2の情報に基づいて開発されました。 MASSCHROQの定量化は、XIC（抽出イオンクロマトグラム）で行われます。XIC抽出とフィルタリングの後、形態変換を使用してピークが検出されます（詳細は説明書を参照）。その後、ピーク領域（すなわち定量値）と境界が計算されます。 ピークマッチングが次のようにして（任意の場合はアラインメントの後に）行われる。検出されたピークは、このペプチドの（整列した）保持時間がピーク境界内に位置する場合に限り、同定されたペプチドに割り当てられる。 MASSCHROQのピークマッチングは、定量化中の最初のものであり、定量化が終了したら、ユーザーは以前に整合されたピークの保持時間を考慮して、1回目のピークマッチングラウンドを実行できます。 さまざまなXICフィルタが入手可能です。移動中央値/平均フィルタの移動信号、背景およびベースラインノイズ除去フィルタ、高解像度の高解像度計、形態学的フィルタなどによって引き起こされるスパイクを除去するためのスパイクフィルタを滑らかにする。 ユーザーはTSV、gnumeric、XHTML、およびMASSCHROQMLフォーマットに結果をエクスポートできます。それらは統計的ソフトウェア（Rのような）または手動/視覚的探査のための自動使用の準備ができています。 低分解能質量分析計と高分解能質量分析計の両方から得られた複雑な標識のないデータに対するMASSCHROQの評価により、技術的再現性（1.4％）およびタンパク質量との相関係数（0.98）の低CVSの測定を可能にした（0.98）
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