ロビンすべての一般的なマイクロアレイプラットフォームをサポートする簡単なマイクロアレイデータプリプロセッサ | |
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ロビン ランキングとまとめ
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- 出版社名:
- Max Planck Institute for Molecular Plant Physiology
- オペレーティングシステム:
- Windows All
- ファイルサイズ:
- 108 MB
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ロビン 説明
現在、統計的にマイクロアレイを統計的に分析するための豊かで単純なユーザーインターフェースを特徴とするGeneSpringのようないくつかの商業プログラムが利用可能です。しかし、これらは通常非常に高価であり、年次購読を必要とするかもしれません 一方、素晴らしい統計的なオプションと無料のサポートを提供する生体コンダクタなどの無料のオープンソースツールがありますが、このツールはしばしばコマンドラインインターフェイスのみであるか、または単に非常に存在するため、使用可能性が高くなることがよくあります。基本的なユーザーの操作 最後に、Richユーザーインターフェイスを提供するRMA Expressなどのツールがありますが、非常に限られたオプションのセットだけです。 ロビンは、個々の生物学者のためのR /生体コンディションの力を解き放つために柔軟なユーザーフレンドリーなグラフィカルインタフェースを提供することによってこのギャップを埋めることを試みます。 Robinは1つのインストール可能なファイルとして提供されています。現在、ROBINを使用すると、Affymetrixデータと一般表の2色または単一のチャンネルアレイデータを正規化方法の範囲を使用して正規化することができます。 さらに、Robinは実験データの技術的品質と構造の概要を得るために使用できるさまざまな品質管理方法を提供しています。内蔵のグラフィカル実験デザイナを使用して、研究者はどのサンプルを比較するサンプル(サンプルの組み合わせも可能)を定義し、最終的に包括的なテーブルを作成し、ログ折り変化(M)などの実験の詳細な結果を与えます。差動表現のための(ユーザ調整可能)確率での平均式(A)値。テーブルは上部100の差動調節された遺伝子に関する情報を要約し、各チップの品質を視覚化するいくつかのプロットも生成される。 結果は、視覚化およびさらなる分析のためにMapManおよびPagemanに直接インポートすることができます。 Robinはあなたにマイクロアレイ分析とデータ処理のための完全な解決策をもたらします。
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