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イマス 説明
IMASまたはインタラクティブマルチゲネモン分析システムは、ゲノム情報における知識の発見のために特別に設計された新しい視覚分析システムです。 IMASは、Glimmer、Blast、Clustalw、Primer3、TranStermなどのツールを使用して、そしてこれらのツールの出力を統一ゲノムフレームワークに視覚化することを使用して、ゲノム科学者のセットを迅速に分析することができます。 IMASは、ゲノムシーケンスへの1次元ズームグラフィカルインタフェースをユーザに提供する。使用者は、遮蔽を用いて局所データベースと遠隔データベースとの配列アラインメントによってさらに分析することができる、使用者と対話することができる。 BLASTの結果は、ユーザーがフィルタリングし、興味のあるヒットのヒットをフィルタリングして選択することを可能にするUnified Graphical Frameworkに表示されます。選択されたブラストヒットは、ClustalWを使用してマルチオングシングすることができ、これらのマルチアニメントは共通のグラフィカルフレームワークを使用して表示されます。 将来の参照のためにユーザーによってマルチエグリーとペアワイズの整列を注釈に付けることができ、これらの発見を示すHTMLレポートを生成することができます。 主な特徴： ズーム可能なユーザーインターフェース - 速い！ 分析プログラムをローカルに実行します（Blast、Glimmer、Clustal ...） IMAS BlastはNCBI NRデータベースを検索できます PFAMデータのローカルコピーでHMMPFAMを実行します。 Insdseq XMLファイルからBLAST DBSを作成できます
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