 | ウイルスゲノムオーガナイザーJavaを介して使用するゲノムブラウザ |
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ウイルスゲノムオーガナイザー ランキングとまとめ
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ウイルスゲノムオーガナイザー 説明
使いやすいJavaベースのゲノムブラウザであるために作成されたウイルスゲノムオーガナイザーまたはVGO。 遺伝子、ORFSおよびSTART / STOPコドンを含む、ゲノムに関する情報を表示するために使用することができる。正規表現検索、ファジィモチーフ検索、およびマスリスト検索を実行するためにも使用できます。 VGOはゲノムシーケンス（VOCS）のデータベースと会談するため、ゲノムを比較するために使用できます。 主な特徴： 遺伝子を見て、1つまたは一連のゲノムで予測されたORFを。 シーケンス内の開始と停止コドンを表示します ゲノム内のシーケンスを検索する 正規表現を使用して。 E.G GGATCCまたはTTTTT T ファジー検索パターンを使用して。例えば1つのミスマッチを許可するGGATCC 組成で最高の遺伝子の場合 GUIを使用してゲノムの領域を選択して抽出します GUIを使用して他のゲノムの遺伝子を選択することによって、ゲノムのセット内のオルソログを表示する ヌクレオチド組成物のプロットを表示します。 一連の整列なゲノムの間で共有されている最長オリゴヌクレオチドを探す 翻訳されたゲノムをマススペックペプチドとの試合に検索する ゲノムディスプレイの上に他のプログラムからのデータをグラフィカルに表示します
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