オントミン オンモミンは、生物活性、毒性および副作用予測のための自動分子採掘に使用されるデータマイニングソフトウェアである。 オンモミンは約100.0から実験的に決定された特性に基づいています
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オントミン 説明

生物活性のための自動分子採掘に使用されるデータマイニングソフトウェア オンモミンは、生物活性、毒性および副作用予測のための自動分子採掘に使用されるデータマイニングソフトウェアです。オンモミンは、データベース、百科事典および他の文献から収集された、約100.000の多様な小分子からの実験的に決定された特性に基づいています。このデータセットは、数千の種類の生物活性、薬物標的、治療地域、悪影響、および毒性の数千のクラスからなる階層木に定式化されています。各クラスは、側鎖/化学活性、環構造などの存在/不在/数のようなそれらの分子特性のための関連分子の指紋によって表される。 オントミンと他の既存の方法との比較 他の現在使用されているすべての生物活性予測アプローチは、3つのカテゴリに分類することができます。 *表現理論と下部構造、位相的および物理化学的な化学記述子 *最大の一般的な下部構造、指紋類似性および機械学習方法 *原子近傍の方法 しかしながら、これらの方法は現在、距離測定基準の依存関係のような要因によって制限されており、活動を表すカットオフは、いくつかの異なるレベルでQSARモデルを構築するのが難しい。薬物標的、バイオプロセスおよび治療領域ならびに結果の解釈。 オンモミン（米国特許取得済み）はこれらの方法に代わって、化学的、生物学的にも薬理学的に関連する分子の構造情報を概念および記述子の階層的スキーマに変換する。 Ontomineは、パターンの分析から推定される規則を使用して、関連するスキーマ内のパターンを発見し、生物学的活動を予測します。オントミンアルゴリズムの1つの重要な利点は、アクティビティに特徴的なパターンが発見されたときにコア足場が保存されないので、足場ホッピングを可能にすることである。 オンモミンパターンは、足場に関係なく、生物活性のための「必要であるが十分ではない」条件を表す。明示的な足場ホッピングは、構成異性体を生成し、ルールベースを使用して興味深い分子を選択することによって行うことができる。オントミンの結果は、活動を表す単純な理解可能なパターンとして提示されています。さらに、オントミン予測は何百万もの分子にスケーラブルである。さらに、構築されたオニトミンデータセットは、社内複合コレクションの測定分子活性の内部データセットを添付することができます。

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